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Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat
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Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat
Suoqin Jin; Christian F. Guerrero‐Juarez; Lihua Zhang; Ivan Chang; Raúl Ramos; Chen‐Hsiang Kuan; Peggy Myung; Maksim V. Plikus · Nature Communications · 2021
Understanding global communications among cells requires accurate representation of cell-cell signaling links and effective systems-level analyses of those links. We construct a database of interactions among ligands, re...
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Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data
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Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data
Kosuke Yoshihara; Maria Shahmoradgoli; Emmanuel Martínez; Rahulsimham Vegesna; Hoon Kim; Wandaliz Torres‐García; Víctor Treviño; Hui Shen · Nature Communications · 2013
Infiltrating stromal and immune cells form the major fraction of normal cells in tumour tissue and not only perturb the tumour signal in molecular studies but also have an important role in cancer biology. Here we descri...
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