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23 resultados encontrados.

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Crystal structure refinement with<i>SHELXL</i>
Artículo
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Crystal structure refinement with<i>SHELXL</i>
George M. Sheldrick · Acta Crystallographica Section C Structural Chemistry · 2014
The improvements in the crystal structure refinement program SHELXL have been closely coupled with the development and increasing importance of the CIF (Crystallographic Information Framework) format for validating and a...
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<i>Mercury CSD 2.0</i>– new features for the visualization and investigation of crystal structures
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
<i>Mercury CSD 2.0</i>– new features for the visualization and investigation of crystal structures
Clare F. Macrae; Ian Bruno; James A. Chisholm; Paul R. Edgington; Patrick McCabe; Elna Pidcock; Lucía Rodríguez-Monge; Robin Taylor · Journal of Applied Crystallography · 2008
The program Mercury , developed by the Cambridge Crystallographic Data Centre, is designed primarily as a crystal structure visualization tool. A new module of functionality has been produced, called the Materials Module...
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<i>SHELXT</i>– Integrated space-group and crystal-structure determination
Artículo
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<i>SHELXT</i>– Integrated space-group and crystal-structure determination
George M. Sheldrick · Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2014
The new computer program SHELXT employs a novel dual-space algorithm to solve the phase problem for single-crystal reflection data expanded to the space group P1. Missing data are taken into account and the resolution ex...
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Bond-valence parameters obtained from a systematic analysis of the Inorganic Crystal Structure Database
Artículo
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Bond-valence parameters obtained from a systematic analysis of the Inorganic Crystal Structure Database
I. D. Brown; D. Altermatt · Acta Crystallographica Section B Structural Science · 1985
Materias / palabras clave: Valence (chemistry); Crystal structure; Materials science; Crystallography; Database; Chemical physics; Chemistry; Computer science; Organic chemistry
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<i>SIR</i>97: a new tool for crystal structure determination and refinement
Artículo
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<i>SIR</i>97: a new tool for crystal structure determination and refinement
Angela Altomare; M. C. Burla; Mercedes Camalli; G. Cascarano; Carmelo Giacovazzo; Antonietta Guagliardi; Anna Moliterni; G. Polidori · Journal of Applied Crystallography · 1999
SIR 97 is the integration of two programs, SIR 92 and CAOS , the first devoted to the solution of crystal structures by direct methods, the second to refinement via least-squares–Fourier procedures. Several new feature...
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Single-crystal structure validation with the program<i>PLATON</i>
Artículo
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Single-crystal structure validation with the program<i>PLATON</i>
Anthony L. Spek · Journal of Applied Crystallography · 2003
The results of a single-crystal structure determination when in CIF format can now be validated routinely by automatic procedures. In this way, many errors in published papers can be avoided. The validation software gene...
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The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures and rising
Artículo
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The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures and rising
Frank H. Allen · Acta Crystallographica Section B Structural Science · 2002
The Cambridge Structural Database (CSD) now contains data for more than a quarter of a million small-molecule crystal structures. The information content of the CSD, together with methods for data acquisition, processing...
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Structure validation in chemical crystallography
Artículo
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Structure validation in chemical crystallography
Anthony L. Spek · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2009
Automated structure validation was introduced in chemical crystallography about 12 years ago as a tool to assist practitioners with the exponential growth in crystal structure analyses. Validation has since evolved into ...
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Crystallography &amp; NMR System: A New Software Suite for Macromolecular Structure Determination
Artículo
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Crystallography &amp; NMR System: A New Software Suite for Macromolecular Structure Determination
Axel T. Brünger; Paul D. Adams; G. Marius Clore; Warren L. DeLano; Piet Gros; Ralf W. Grosse‐Kunstleve; Jiansheng Jiang; John Kuszewski · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 1998
A new software suite, called Crystallography & NMR System (CNS), has been developed for macromolecular structure determination by X-ray crystallography or solution nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. In contra...
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Synthesis, structure, and spectroscopic properties of copper(<scp>II</scp>) compounds containing nitrogen–sulphur donor ligands; the crystal and molecular structure of aqua[1,7-bis(N-methylbenzimidazol-2′-yl)-2,6-dithiaheptane]copper(<scp>II</scp>) perchlorate
Artículo
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Synthesis, structure, and spectroscopic properties of copper(<scp>II</scp>) compounds containing nitrogen–sulphur donor ligands; the crystal and molecular structure of aqua[1,7-bis(N-methylbenzimidazol-2′-yl)-2,6-dithiaheptane]copper(<scp>II</scp>) perchlorate
Anthony W. Addison; T. Nageswara Rao; J. Reedijk; Jacobus Van Rijn; G. C. Verschoor · Journal of the Chemical Society Dalton Transactions · 1984
The linear quadridentate N2S2 donor ligand 1,7-bis(N-methylbenzimidazol-2′-yl)-2,6-dithiaheptane (bmdhp) forms mono- and di-hydrate 1 : 1 copper(II) complexes which are significantly more stable toward autoreduction th...
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<i>MolProbity</i>: all-atom structure validation for macromolecular crystallography
Artículo
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<i>MolProbity</i>: all-atom structure validation for macromolecular crystallography
Vincent B. Chen; W.B. Arendall; Jeffrey J. Headd; D.A. Keedy; Robert M. Immormino; Gary J. Kapral; Laura W. Murray; Jane S. Richardson · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2009
MolProbity is a structure-validation web service that provides broad-spectrum solidly based evaluation of model quality at both the global and local levels for both proteins and nucleic acids. It relies heavily on the po...
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<i>Phaser</i>crystallographic software
Artículo
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<i>Phaser</i>crystallographic software
Airlie J. McCoy; Ralf W. Grosse‐Kunstleve; Paul D. Adams; Martyn Winn; Laurent C. Storoni; Randy J. Read · Journal of Applied Crystallography · 2007
Phaser is a program for phasing macromolecular crystal structures by both molecular replacement and experimental phasing methods. The novel phasing algorithms implemented in Phaser have been developed using maximum likel...
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Dictionary of protein secondary structure: Pattern recognition of hydrogen‐bonded and geometrical features
Artículo
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Dictionary of protein secondary structure: Pattern recognition of hydrogen‐bonded and geometrical features
Wolfgang Kabsch; Christian Sander · Biopolymers · 1983
Abstract For a successful analysis of the relation between amino acid sequence and protein structure, an unambiguous and physically meaningful definition of secondary structure is essential. We have developed a set of si...
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<i>VESTA 3</i> for three-dimensional visualization of crystal, volumetric and morphology data
Artículo
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<i>VESTA 3</i> for three-dimensional visualization of crystal, volumetric and morphology data
Koichi Momma; Fujio Izumi · Journal of Applied Crystallography · 2011
VESTA is a three-dimensional visualization system for crystallographic studies and electronic state calculations. It has been upgraded to the latest version, VESTA 3 , implementing new features including drawing the exte...
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<i>OLEX2</i>: a complete structure solution, refinement and analysis program
Artículo
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<i>OLEX2</i>: a complete structure solution, refinement and analysis program
Oleg V. Dolomanov; Luc J. Bourhis; Richard J. Gildea; Judith A. K. Howard; Horst Puschmann · Journal of Applied Crystallography · 2009
New software, OLEX2 , has been developed for the determination, visualization and analysis of molecular crystal structures. The software has a portable mouse-driven workflow-oriented and fully comprehensive graphical use...
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Elements of X-Ray Diffraction
Libro electrónico
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Elements of X-Ray Diffraction
B. D. Cullity; John W. Weymouth · American Journal of Physics · 1957
1. Properties of X-rays. 2. Geometry of Crystals. 3. Diffraction I: Directions of Diffracted Beams. 4. Diffraction II: Intensities of Diffracted Beams. 5. Diffraction III: Non-Ideal Samples. 6. Laure Photographs. 7. Powd...
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All-Atom Empirical Potential for Molecular Modeling and Dynamics Studies of Proteins
Artículo
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All-Atom Empirical Potential for Molecular Modeling and Dynamics Studies of Proteins
Alexander D. MacKerell; Donald Bashford; M. Bellott; Roland L. Dunbrack; Jeffrey D. Evanseck; Martin J. Field; Stefan Fischer; Jun Gao · The Journal of Physical Chemistry B · 1998
New protein parameters are reported for the all-atom empirical energy function in the CHARMM program. The parameter evaluation was based on a self-consistent approach designed to achieve a balance between the internal (b...
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The Cambridge Structural Database
Artículo
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The Cambridge Structural Database
Colin R. Groom; Ian Bruno; Matthew P. Lightfoot; Suzanna C. Ward · Acta Crystallographica Section B Structural Science Crystal Engineering and Materials · 2016
The Cambridge Structural Database (CSD) contains a complete record of all published organic and metal-organic small-molecule crystal structures. The database has been in operation for over 50 years and continues to be th...
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Development and testing of a general amber force field
Artículo
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Development and testing of a general amber force field
Junmei Wang; Romain M. Wolf; James W. Caldwell; Peter A. Kollman; David A. Case · Journal of Computational Chemistry · 2004
We describe here a general Amber force field (GAFF) for organic molecules. GAFF is designed to be compatible with existing Amber force fields for proteins and nucleic acids, and has parameters for most organic and pharma...
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Improved methods for building protein models in electron density maps and the location of errors in these models
Artículo
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Improved methods for building protein models in electron density maps and the location of errors in these models
T. Alwyn Jones; Jin-yu Zou; Sandra W. Cowan; Morten Kjeldgaard · Acta Crystallographica Section A Foundations of Crystallography · 1991
Map interpretation remains a critical step in solving the structure of a macromolecule. Errors introduced at this early stage may persist throughout crystallographic refinement and result in an incorrect structure. The n...
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Avogadro: an advanced semantic chemical editor, visualization, and analysis platform
Artículo
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Avogadro: an advanced semantic chemical editor, visualization, and analysis platform
Marcus D. Hanwell; Donald Curtis; David Lonie; Tim Vandermeersch; Eva Zurek; Geoffrey Hutchison · Journal of Cheminformatics · 2012
BACKGROUND: The Avogadro project has developed an advanced molecule editor and visualizer designed for cross-platform use in computational chemistry, molecular modeling, bioinformatics, materials science, and related are...
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The Chemistry and Applications of Metal-Organic Frameworks
Artículo
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The Chemistry and Applications of Metal-Organic Frameworks
Hiroyasu Furukawa; Kyle E. Cordova; M. O’Keeffe; Omar M. Yaghi · Science · 2013
Background Metal-organic frameworks (MOFs) are made by linking inorganic and organic units by strong bonds (reticular synthesis). The flexibility with which the constituents’ geometry, size, and functionality can be va...
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Small Structures
Artículo
Acceso abierto Artículo DOAJ
Small Structures
Wiley-VCH; Germany · ISSN 2688-4062
Materias / palabras clave: atomic structures, chemical structures, crystal structures, nanostructures, mesostructures, microstructures; Science: Physics; Science: Chemistry
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