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60 resultados encontrados.

Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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Introduction to automata theory, languages and computation
Artículo
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Introduction to automata theory, languages and computation
Mathematics and Computers in Simulation · 1981
Materias / palabras clave: Exposition (narrative); Computer science; Automaton; Computation; Theory of computation; Theoretical computer science; Automata theory; Formal language; Model of computation; Programming language; Art; Literature
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Effect of the damping function in dispersion corrected density functional theory
Artículo
Página del recurso disponible Artículo OpenAlex
Effect of the damping function in dispersion corrected density functional theory
Stefan Grimme; Stephan Ehrlich; Lars Goerigk · Journal of Computational Chemistry · 2011
It is shown by an extensive benchmark on molecular energy data that the mathematical form of the damping function in DFT-D methods has only a minor impact on the quality of the results. For 12 different functionals, a st...
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Density Functional Theory of Atoms and Molecules
Capítulo
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Density Functional Theory of Atoms and Molecules
Robert G. Parr · OpenAlex · 1980
Materias / palabras clave: Electronegativity; Density functional theory; Time-dependent density functional theory; Atom (system on chip); Functional theory; Orbital-free density functional theory; Molecule; Atoms in molecules; Density matrix; Comp...
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STRING v10: protein–protein interaction networks, integrated over the tree of life
Artículo
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STRING v10: protein–protein interaction networks, integrated over the tree of life
Damian Szklarczyk; Andrea Franceschini; Stefan Wyder; Kristoffer Forslund; Davide Heller; Jaime Huerta‐Cepas; Milan Simonovic; Alexander Röth · Nucleic Acids Research · 2014
The many functional partnerships and interactions that occur between proteins are at the core of cellular processing and their systematic characterization helps to provide context in molecular systems biology. However, k...
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A consistent and accurate<i>ab initio</i>parametrization of density functional dispersion correction (DFT-D) for the 94 elements H-Pu
Artículo
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A consistent and accurate<i>ab initio</i>parametrization of density functional dispersion correction (DFT-D) for the 94 elements H-Pu
Stefan Grimme; Jens Antony; Stephan Ehrlich; Helge Krieg · The Journal of Chemical Physics · 2010
The method of dispersion correction as an add-on to standard Kohn-Sham density functional theory (DFT-D) has been refined regarding higher accuracy, broader range of applicability, and less empiricism. The main new ingre...
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An Integrative Theory of Prefrontal Cortex Function
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An Integrative Theory of Prefrontal Cortex Function
Earl K. Miller; Jonathan D. Cohen · Annual Review of Neuroscience · 2001
The prefrontal cortex has long been suspected to play an important role in cognitive control, in the ability to orchestrate thought and action in accordance with internal goals. Its neural basis, however, has remained a ...
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Elements of Information Theory
Libro electrónico
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Elements of Information Theory
Thomas M. Cover; Joy A. Thomas · OpenAlex · 2001
Preface to the Second Edition. Preface to the First Edition. Acknowledgments for the Second Edition. Acknowledgments for the First Edition. 1. Introduction and Preview. 1.1 Preview of the Book. 2. Entropy, Relative Entro...
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Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies
Artículo
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Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies
Daniel H. Huson; David Bryant · Molecular Biology and Evolution · 2005
The evolutionary history of a set of taxa is usually represented by a phylogenetic tree, and this model has greatly facilitated the discussion and testing of hypotheses. However, it is well known that more complex evolut...
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Interactive Tree Of Life (iTOL) v5: an online tool for phylogenetic tree display and annotation
Artículo
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Interactive Tree Of Life (iTOL) v5: an online tool for phylogenetic tree display and annotation
Ivica Letunić; Peer Bork · Nucleic Acids Research · 2021
The Interactive Tree Of Life (https://itol.embl.de) is an online tool for the display, manipulation and annotation of phylogenetic and other trees. It is freely available and open to everyone. iTOL version 5 introduces a...
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GASFLOW-MPI: A Scalable Computational Fluid Dynamics Code for Gases, Aerosols and Combustion. Band 1 (Theory and Computational Model (Revision 1.0) und Band 2 (Users' Manual). (KIT Scientific Reports ; 7710 und 7711)
Libro electrónico
Material complementario disponible Libro electrónico DOAB
GASFLOW-MPI: A Scalable Computational Fluid Dynamics Code for Gases, Aerosols and Combustion. Band 1 (Theory and Computational Model (Revision 1.0) und Band 2 (Users' Manual). (KIT Scientific Reports ; 7710 und 7711)
Xiao, JianjunTravis, JackRoyl, PeterNecker, GottfriedSvishchev, AnatolyJordan, Thomas · KIT Scientific Publishing · ISBN 9783731504474
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A new mixing of Hartree–Fock and local density-functional theories
Artículo
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A new mixing of Hartree–Fock and local density-functional theories
Axel D. Becke · The Journal of Chemical Physics · 1993
Previous attempts to combine Hartree–Fock theory with local density-functional theory have been unsuccessful in applications to molecular bonding. We derive a new coupling of these two theories that maintains their sim...
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Information Theory and Statistical Mechanics
Artículo
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Information Theory and Statistical Mechanics
E. T. Jaynes · Physical Review · 1957
Information theory provides a constructive criterion for setting up probability distributions on the basis of partial knowledge, and leads to a type of statistical inference which is called the maximum-entropy estimate. ...
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Balanced basis sets of split valence, triple zeta valence and quadruple zeta valence quality for H to Rn: Design and assessment of accuracy
Artículo
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Balanced basis sets of split valence, triple zeta valence and quadruple zeta valence quality for H to Rn: Design and assessment of accuracy
Florian Weigend; Reinhart Ahlrichs · Physical Chemistry Chemical Physics · 2005
Gaussian basis sets of quadruple zeta valence quality for Rb-Rn are presented, as well as bases of split valence and triple zeta valence quality for H-Rn. The latter were obtained by (partly) modifying bases developed pr...
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The M06 suite of density functionals for main group thermochemistry, thermochemical kinetics, noncovalent interactions, excited states, and transition elements: two new functionals and systematic testing of four M06-class functionals and 12 other functionals
Artículo
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The M06 suite of density functionals for main group thermochemistry, thermochemical kinetics, noncovalent interactions, excited states, and transition elements: two new functionals and systematic testing of four M06-class functionals and 12 other functionals
Yan Zhao; Donald G. Truhlar · Theoretical Chemistry Accounts · 2007
We present two new hybrid meta exchange- correlation functionals, called M06 and M06-2X. The M06 functional is parametrized including both transition metals and nonmetals, whereas the M06-2X functional is a high-nonlocal...
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Density-functional thermochemistry. III. The role of exact exchange
Artículo
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Density-functional thermochemistry. III. The role of exact exchange
Axel D. Becke · The Journal of Chemical Physics · 1993
Despite the remarkable thermochemical accuracy of Kohn–Sham density-functional theories with gradient corrections for exchange-correlation [see, for example, A. D. Becke, J. Chem. Phys. 96, 2155 (1992)], we believe tha...
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Efficiency of ab-initio total energy calculations for metals and semiconductors using a plane-wave basis set
Artículo
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Efficiency of ab-initio total energy calculations for metals and semiconductors using a plane-wave basis set
Georg Kresse; J. Furthmüller · Computational Materials Science · 1996
Materias / palabras clave: Ab initio; Hamiltonian (control theory); Basis set; Plane wave; Statistical physics; Ab initio quantum chemistry methods; Density functional theory; Electronic structure; Phonon; Degrees of freedom (physics and chemistry...
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A new optimizer using particle swarm theory
Artículo
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A new optimizer using particle swarm theory
R.C. Eberhart; James Kennedy · OpenAlex · 2002
The optimization of nonlinear functions using particle swarm methodology is described. Implementations of two paradigms are discussed and compared, including a recently developed locally oriented paradigm. Benchmark test...
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Computer Simulation of Liquids
Libro electrónico
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Computer Simulation of Liquids
Michael P. Allen; Dominic J. Tildesley · OpenAlex · 2017
Abstract This book provides a practical guide to molecular dynamics and Monte Carlo simulation techniques used in the modelling of simple and complex liquids. Computer simulation is an essential tool in studying the chem...
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Fast unfolding of communities in large networks
Artículo
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Fast unfolding of communities in large networks
Vincent D. Blondel; Jean‐Loup Guillaume; Renaud Lambiotte; Etienne Lefebvre · Journal of Statistical Mechanics Theory and Experiment · 2008
We propose a simple method to extract the community structure of large networks. Our method is a heuristic method that is based on modularity optimization. It is shown to outperform all other known community detection me...
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ff14SB: Improving the Accuracy of Protein Side Chain and Backbone Parameters from ff99SB
Artículo
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ff14SB: Improving the Accuracy of Protein Side Chain and Backbone Parameters from ff99SB
James Maier; Carmenza Martinez; Koushik Kasavajhala; Lauren Wickstrom; Kevin Hauser; Carlos Simmerling · Journal of Chemical Theory and Computation · 2015
Molecular mechanics is powerful for its speed in atomistic simulations, but an accurate force field is required. The Amber ff99SB force field improved protein secondary structure balance and dynamics from earlier force f...
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Rethinking the Inception Architecture for Computer Vision
Artículo
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Rethinking the Inception Architecture for Computer Vision
Christian Szegedy; Vincent Vanhoucke; Sergey Ioffe; Jon Shlens; Zbigniew Wojna · OpenAlex · 2016
Convolutional networks are at the core of most state of-the-art computer vision solutions for a wide variety of tasks. Since 2014 very deep convolutional networks started to become mainstream, yielding substantial gains ...
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IQ-TREE 2: New Models and Efficient Methods for Phylogenetic Inference in the Genomic Era
Artículo
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IQ-TREE 2: New Models and Efficient Methods for Phylogenetic Inference in the Genomic Era
Bùi Quang Minh; Heiko A. Schmidt; Olga Chernomor; Dominik Schrempf; Michael D. Woodhams; Arndt von Haeseler; Robert Lanfear · Molecular Biology and Evolution · 2020
IQ-TREE (http://www.iqtree.org, last accessed February 6, 2020) is a user-friendly and widely used software package for phylogenetic inference using maximum likelihood. Since the release of version 1 in 2014, we have con...
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MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods
Artículo
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MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods
Koichiro Tamura; Daniel G. Peterson; Nora Peterson; Glen Stecher; M Nei; Sudhir Kumar · Molecular Biology and Evolution · 2011
Comparative analysis of molecular sequence data is essential for reconstructing the evolutionary histories of species and inferring the nature and extent of selective forces shaping the evolution of genes and species. He...
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The ORCA program system
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The ORCA program system
Frank Neese · Wiley Interdisciplinary Reviews Computational Molecular Science · 2011
Abstract ORCA is a general‐purpose quantum chemistry program package that features virtually all modern electronic structure methods (density functional theory, many‐body perturbation and coupled cluster theories, an...
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