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Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies
Artículo
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Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies
Daniel H. Huson; David Bryant · Molecular Biology and Evolution · 2005
The evolutionary history of a set of taxa is usually represented by a phylogenetic tree, and this model has greatly facilitated the discussion and testing of hypotheses. However, it is well known that more complex evolut...
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Balanced basis sets of split valence, triple zeta valence and quadruple zeta valence quality for H to Rn: Design and assessment of accuracy
Artículo
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Balanced basis sets of split valence, triple zeta valence and quadruple zeta valence quality for H to Rn: Design and assessment of accuracy
Florian Weigend; Reinhart Ahlrichs · Physical Chemistry Chemical Physics · 2005
Gaussian basis sets of quadruple zeta valence quality for Rb-Rn are presented, as well as bases of split valence and triple zeta valence quality for H-Rn. The latter were obtained by (partly) modifying bases developed pr...
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Scalable molecular dynamics with NAMD
Artículo
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Scalable molecular dynamics with NAMD
J. C. Phillips; Rosemary Braun; Wei Wang; James C. Gumbart; Emad Tajkhorshid; Elizabeth Villa; Christophe Chipot; Robert D. Skeel · Journal of Computational Chemistry · 2005
NAMD is a parallel molecular dynamics code designed for high-performance simulation of large biomolecular systems. NAMD scales to hundreds of processors on high-end parallel platforms, as well as tens of processors on lo...
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First principles methods using CASTEP
Artículo
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First principles methods using CASTEP
Stewart J. Clark; Matthew Segall; Chris J. Pickard; P. J. Hasnip; Matt Probert; Keith Refson; M. C. Payne · Zeitschrift für Kristallographie - Crystalline Materials · 2005
Abstract The CASTEP code for first principles electronic structure calculations will be described. A brief, non-technical overview will be given and some of the features and capabilities highlighted. Some features which ...
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