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Development of a Dual-Index Sequencing Strategy and Curation Pipeline for Analyzing Amplicon Sequence Data on the MiSeq Illumina Sequencing Platform
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Development of a Dual-Index Sequencing Strategy and Curation Pipeline for Analyzing Amplicon Sequence Data on the MiSeq Illumina Sequencing Platform
James J. Kozich; Sarah L. Westcott; Nielson T. Baxter; Sarah K. Highlander; Patrick D. Schloss · Applied and Environmental Microbiology · 2013
Rapid advances in sequencing technology have changed the experimental landscape of microbial ecology. In the last 10 years, the field has moved from sequencing hundreds of 16S rRNA gene fragments per study using clone li...
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PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences
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PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences
Magali Lescot · Nucleic Acids Research · 2002
PlantCARE is a database of plant cis-acting regulatory elements, enhancers and repressors. Regulatory elements are represented by positional matrices, consensus sequences and individual sites on particular promoter seque...
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The Pfam protein families database: towards a more sustainable future
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The Pfam protein families database: towards a more sustainable future
ROBERT FINN; Penelope Coggill; Ruth Y. Eberhardt; Sean R. Eddy; Jaina Mistry; Alex Mitchell; Simon Potter; Marco Punta · Nucleic Acids Research · 2015
In the last two years the Pfam database (http://pfam.xfam.org) has undergone a substantial reorganisation to reduce the effort involved in making a release, thereby permitting more frequent releases. Arguably the most si...
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Reference sequence (RefSeq) database at NCBI: current status, taxonomic expansion, and functional annotation
Articolo
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Reference sequence (RefSeq) database at NCBI: current status, taxonomic expansion, and functional annotation
Nuala A. O’Leary; Matt W. Wright; J. Rodney Brister; Stacy Ciufo; Diana Haddad; Rich McVeigh; Bhanu Rajput; Barbara Robbertse · Nucleic Acids Research · 2015
The RefSeq project at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) maintains and curates a publicly available database of annotated genomic, transcript, and protein sequence records (http://www.ncbi.nlm.nih.g...
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Curaduría :
Libro
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Curaduría :
Bhaskar, Michael · Fondo de Cultura Económica · 2017 · ISBN 9786071654892
Materie / parole chiave: Information behavior; Knowledge management; Data curation; Information literacy; Curatorship; Choice (Psychology); Decision making; Document selection; Information storage and retrieval systems; Electronic books
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Gestión y reutilización de datos científicos :
Libro
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Gestión y reutilización de datos científicos :
Travieso, Críspulo · Ediciones Universidad de Salamanca · 2025 · ISBN 9788410911352
Materie / parole chiave: Research; Data processing; Management; Open scholarship; Data curation; Digital preservation; Institutional repositories
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MITOS: Improved de novo metazoan mitochondrial genome annotation
Articolo
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MITOS: Improved de novo metazoan mitochondrial genome annotation
Matthias Bernt; Alexander Donath; Frank Jühling; Fabian Externbrink; Catherine Florentz; Guido Fritzsch; Joern Pütz; Martin Middendorf · Molecular Phylogenetics and Evolution · 2012
Materie / parole chiave: RefSeq; Annotation; Biology; Genome; Pipeline (software); Gene Annotation; Mitochondrial DNA; Computational biology; Data curation; Gene; Computer science; Genetics
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