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GROMACS 4.5: a high-throughput and highly parallel open source molecular simulation toolkit
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GROMACS 4.5: a high-throughput and highly parallel open source molecular simulation toolkit
Sander Pronk; Szilárd Páll; Roland Schulz; Per Larsson; Pär Bjelkmar; Rossen Apostolov; Michael R. Shirts; Jeremy C. Smith · Bioinformatics · 2013
MOTIVATION: Molecular simulation has historically been a low-throughput technique, but faster computers and increasing amounts of genomic and structural data are changing this by enabling large-scale automated simulation...
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DnaSP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods
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DnaSP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods
Julio Rozas; Juan Carlos Sánchez-DelBarrio; Xavier Messeguer; R. Rozas · Bioinformatics · 2003
SUMMARY: DnaSP is a software package for the analysis of DNA polymorphism data. Present version introduces several new modules and features which, among other options allow: (1) handling big data sets (approximately 5 Mb...
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