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Density Functionals with Broad Applicability in Chemistry
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Density Functionals with Broad Applicability in Chemistry
Yan Zhao; Donald G. Truhlar · Accounts of Chemical Research · 2008
Although density functional theory is widely used in the computational chemistry community, the most popular density functional, B3LYP, has some serious shortcomings: (i) it is better for main-group chemistry than for tr...
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GROMACS 4: Algorithms for Highly Efficient, Load-Balanced, and Scalable Molecular Simulation
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GROMACS 4: Algorithms for Highly Efficient, Load-Balanced, and Scalable Molecular Simulation
Berk Hess; Carsten Kutzner; David van der Spoel; Erik Lindahl · Journal of Chemical Theory and Computation · 2008
Molecular simulation is an extremely useful, but computationally very expensive tool for studies of chemical and biomolecular systems. Here, we present a new implementation of our molecular simulation toolkit GROMACS whi...
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Exploring Network Structure, Dynamics, and Function using NetworkX
Articolo
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Exploring Network Structure, Dynamics, and Function using NetworkX
Aric Hagberg; Dan Schult; Pieter J. Swart · Proceedings of the Python in Science Conferences · 2008
NetworkX is a Python language package for exploration and analysis of networks and network algorithms. The core package provides data structures for representing many types of networks, or graphs, including simple graphs...
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