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MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment
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MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment
Sudhir Kumar · Briefings in Bioinformatics · 2004
With its theoretical basis firmly established in molecular evolutionary and population genetics, the comparative DNA and protein sequence analysis plays a central role in reconstructing the evolutionary histories of spec...
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Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method
Articolo
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Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method
Koichiro Tamura; Masatoshi Nei; Sudhir Kumar · Proceedings of the National Academy of Sciences · 2004
Current efforts to reconstruct the tree of life and histories of multigene families demand the inference of phylogenies consisting of thousands of gene sequences. However, for such large data sets even a moderate explora...
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Versatile and open software for comparing large genomes
Articolo
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Versatile and open software for comparing large genomes
Stefan Kurtz; Adam M. Phillippy; Arthur L. Delcher; Michael Smoot; Martin Shumway; Corina Antonescu; Steven L. Salzberg · Genome biology · 2004
The newest version of MUMmer easily handles comparisons of large eukaryotic genomes at varying evolutionary distances, as demonstrated by applications to multiple genomes. Two new graphical viewing tools provide alternat...
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Network biology: understanding the cell's functional organization
Testo / risorsa
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Network biology: understanding the cell's functional organization
Albert-Ĺaszló Barabási; Zoltán N. Oltvai · Nature Reviews Genetics · 2004
Materie / parole chiave: Biology; Systems biology; Function (biology); Computational biology; Key (lock); Conceptual framework; Cognitive science; Evolutionary biology; Ecology; Epistemology; Philosophy; Psychology
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