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DAVID: Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery
Artículo
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DAVID: Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery
Glynn Dennis; Brad T. Sherman; Douglas A Hosack; Jun Yang; Wei Gao; H. Clifford Lane; Richard A. Lempicki · Genome biology · 2003
BACKGROUND: Functional annotation of differentially expressed genes is a necessary and critical step in the analysis of microarray data. The distributed nature of biological knowledge frequently requires researchers to n...
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Gene ontology analysis for RNA-seq: accounting for selection bias
Artículo
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Gene ontology analysis for RNA-seq: accounting for selection bias
Matthew D. Young; Matthew J. Wakefield; Gordon K. Smyth; Alicia Oshlack · Genome biology · 2010
We present GOseq, an application for performing Gene Ontology (GO) analysis on RNA-seq data. GO analysis is widely used to reduce complexity and highlight biological processes in genome-wide expression studies, but stand...
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