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Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes
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Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes
Jo Vandesompele; Katleen De Preter; Filip Pattyn; Bruce Poppe; Nadine Van Roy; Anne De Paepe; Frank Speleman · Genome biology · 2002
BACKGROUND: Gene-expression analysis is increasingly important in biological research, with real-time reverse transcription PCR (RT-PCR) becoming the method of choice for high-throughput and accurate expression profiling...
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Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome
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Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome
Ben Langmead; Cole Trapnell; Mihai Pop; Steven L. Salzberg · Genome biology · 2009
Bowtie is an ultrafast, memory-efficient alignment program for aligning short DNA sequence reads to large genomes. For the human genome, Burrows-Wheeler indexing allows Bowtie to align more than 25 million reads per CPU ...
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