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3 resultados encontrados.

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CHARMM general force field: A force field for drug‐like molecules compatible with the CHARMM all‐atom additive biological force fields
Artículo
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Kenno Vanommeslaeghe; Elizabeth Hatcher; Chitrangada Acharya; Subhas C. Kundu; Shan Zhong; J. Shim; Eva Darian; Olgun Guvench · Journal of Computational Chemistry · 2009
The widely used CHARMM additive all-atom force field includes parameters for proteins, nucleic acids, lipids, and carbohydrates. In the present article, an extension of the CHARMM force field to drug-like molecules is pr...
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CHARMM: The biomolecular simulation program
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Bernard R. Brooks; Charles L. Brooks; Alexander D. MacKerell; Lennart Nilsson; Robert J. Petrella; Benoı̂t Roux; Youngdo Won; Georgios Archontis · Journal of Computational Chemistry · 2009
CHARMM (Chemistry at HARvard Molecular Mechanics) is a highly versatile and widely used molecular simulation program. It has been developed over the last three decades with a primary focus on molecules of biological inte...
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GROMACS: Fast, flexible, and free
Artículo
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David van der Spoel; Erik Lindahl; Berk Hess; Gerrit Groenhof; Alan E. Mark; Herman J. C. Berendsen · Journal of Computational Chemistry · 2005
This article describes the software suite GROMACS (Groningen MAchine for Chemical Simulation) that was developed at the University of Groningen, The Netherlands, in the early 1990s. The software, written in ANSI C, origi...
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