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limma powers differential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies
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limma powers differential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies
Matthew E. Ritchie; Belinda Phipson; Di Wu; Yifang Hu; Charity W. Law; Wei Shi; Gordon K. Smyth · Nucleic Acids Research · 2015
limma is an R/Bioconductor software package that provides an integrated solution for analysing data from gene expression experiments. It contains rich features for handling complex experimental designs and for informatio...
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The PRIDE database and related tools and resources in 2019: improving support for quantification data
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The PRIDE database and related tools and resources in 2019: improving support for quantification data
Yasset Pérez‐Riverol; Attila Csordás; Jingwen Bai; Manuel Bernal Llinares; Suresh Hewapathirana; Deepti J Kundu; Avinash Inuganti; Johannes Griss · Nucleic Acids Research · 2018
The PRoteomics IDEntifications (PRIDE) database (https://www.ebi.ac.uk/pride/) is the world's largest data repository of mass spectrometry-based proteomics data, and is one of the founding members of the global ProteomeX...
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