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Unicycler: Resolving bacterial genome assemblies from short and long sequencing reads
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Unicycler: Resolving bacterial genome assemblies from short and long sequencing reads
Ryan R. Wick; Louise M. Judd; Claire L. Gorrie; Kathryn E. Holt · PLoS Computational Biology · 2017
The Illumina DNA sequencing platform generates accurate but short reads, which can be used to produce accurate but fragmented genome assemblies. Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies DNA sequencing platfor...
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Material complementario
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Accelerated Profile HMM Searches
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Accelerated Profile HMM Searches
Sean R. Eddy · PLoS Computational Biology · 2011
Profile hidden Markov models (profile HMMs) and probabilistic inference methods have made important contributions to the theory of sequence database homology search. However, practical use of profile HMM methods has been...
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