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QUAST: quality assessment tool for genome assemblies
Artículo
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QUAST: quality assessment tool for genome assemblies
Alexey Gurevich; Vladislav Saveliev; Nikolay Vyahhi; Glenn Tesler · Bioinformatics · 2013
SUMMARY: Limitations of genome sequencing techniques have led to dozens of assembly algorithms, none of which is perfect. A number of methods for comparing assemblers have been developed, but none is yet a recognized ben...
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De novo transcript sequence reconstruction from RNA-seq using the Trinity platform for reference generation and analysis
Artículo
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De novo transcript sequence reconstruction from RNA-seq using the Trinity platform for reference generation and analysis
Brian J. Haas; Alexie Papanicolaou; Moran Yassour; Manfred Grabherr; Philip D. Blood; Joshua C. Bowden; Matthew Brian Couger; David Eccles · Nature Protocols · 2013
Materias / palabras clave: Computational biology; Bioconductor; RNA-Seq; Sequence assembly; Workflow; Transcriptome; Biology; De novo transcriptome assembly; Genome; Reference genome; Computer science; Sequence analysis
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The Chemistry and Applications of Metal-Organic Frameworks
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The Chemistry and Applications of Metal-Organic Frameworks
Hiroyasu Furukawa; Kyle E. Cordova; M. O’Keeffe; Omar M. Yaghi · Science · 2013
Background Metal-organic frameworks (MOFs) are made by linking inorganic and organic units by strong bonds (reticular synthesis). The flexibility with which the constituents’ geometry, size, and functionality can be va...
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