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94 resultados encontrados.

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Crystal structure refinement with<i>SHELXL</i>
Artículo
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Crystal structure refinement with<i>SHELXL</i>
George M. Sheldrick · Acta Crystallographica Section C Structural Chemistry · 2014
The improvements in the crystal structure refinement program SHELXL have been closely coupled with the development and increasing importance of the CIF (Crystallographic Information Framework) format for validating and a...
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Development and testing of a general amber force field
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Development and testing of a general amber force field
Junmei Wang; Romain M. Wolf; James W. Caldwell; Peter A. Kollman; David A. Case · Journal of Computational Chemistry · 2004
We describe here a general Amber force field (GAFF) for organic molecules. GAFF is designed to be compatible with existing Amber force fields for proteins and nucleic acids, and has parameters for most organic and pharma...
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Dictionary of protein secondary structure: Pattern recognition of hydrogen‐bonded and geometrical features
Artículo
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Dictionary of protein secondary structure: Pattern recognition of hydrogen‐bonded and geometrical features
Wolfgang Kabsch; Christian Sander · Biopolymers · 1983
Abstract For a successful analysis of the relation between amino acid sequence and protein structure, an unambiguous and physically meaningful definition of secondary structure is essential. We have developed a set of si...
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From ultrasoft pseudopotentials to the projector augmented-wave method
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
From ultrasoft pseudopotentials to the projector augmented-wave method
Georg Kresse; Daniel P. Joubert · Physical review. B, Condensed matter · 1999
The formal relationship between ultrasoft (US) Vanderbilt-type pseudopotentials and Bl\"ochl's projector augmented wave (PAW) method is derived. It is shown that the total energy functional for US pseudopotentials can be...
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Glide: A New Approach for Rapid, Accurate Docking and Scoring. 1. Method and Assessment of Docking Accuracy
Artículo
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Glide: A New Approach for Rapid, Accurate Docking and Scoring. 1. Method and Assessment of Docking Accuracy
Richard A. Friesner; Jay L. Banks; Robert B. Murphy; Thomas A. Halgren; Jasna Klicić; Daniel T. Mainz; Matthew P. Repasky; Eric H. Knoll · Journal of Medicinal Chemistry · 2004
Unlike other methods for docking ligands to the rigid 3D structure of a known protein receptor, Glide approximates a complete systematic search of the conformational, orientational, and positional space of the docked lig...
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Interpretation of Raman spectra of disordered and amorphous carbon
Artículo
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Interpretation of Raman spectra of disordered and amorphous carbon
Andrea C. Ferrari; John Robertson · Physical review. B, Condensed matter · 2000
The model and theoretical understanding of the Raman spectra in disordered and amorphous carbon are given. The nature of the G and D vibration modes in graphite is analyzed in terms of the resonant excitation of \ensurem...
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Item-based collaborative filtering recommendation algorithms
Artículo
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Item-based collaborative filtering recommendation algorithms
Badrul Sarwar; George Karypis; Joseph A. Konstan; John Riedl · OpenAlex · 2001
Recommender systems apply knowledge discovery techniques to the problem of making personalized recommendations for information, products or services during a liveinteraction. These systems, especially the k-nearest neigh...
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Possible highT c superconductivity in the Ba?La?Cu?O system
Artículo
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Possible highT c superconductivity in the Ba?La?Cu?O system
J. G. Bednorz; K. A. M�ller · The European Physical Journal B · 1986
Materias / palabras clave: Superconductivity; Electrical resistivity and conductivity; Crystallite; Condensed matter physics; Perovskite (structure); Copper; Materials science; Metal; Analytical Chemistry (journal); Chemistry; Crystallography; Met...
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Revised effective ionic radii and systematic studies of interatomic distances in halides and chalcogenides
Artículo
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Revised effective ionic radii and systematic studies of interatomic distances in halides and chalcogenides
R. D. Shannon · Acta Crystallographica Section A · 1976
The effective ionic radii of Shannon & Prewitt [Acta Cryst. (1969), B25, 925-945] are revised to include more unusual oxidation states and coordinations. Revisions are based on new structural data, empirical bond strengt...
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Synthesis, structure, and spectroscopic properties of copper(<scp>II</scp>) compounds containing nitrogen–sulphur donor ligands; the crystal and molecular structure of aqua[1,7-bis(N-methylbenzimidazol-2′-yl)-2,6-dithiaheptane]copper(<scp>II</scp>) perchlorate
Artículo
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Synthesis, structure, and spectroscopic properties of copper(<scp>II</scp>) compounds containing nitrogen–sulphur donor ligands; the crystal and molecular structure of aqua[1,7-bis(N-methylbenzimidazol-2′-yl)-2,6-dithiaheptane]copper(<scp>II</scp>) perchlorate
Anthony W. Addison; T. Nageswara Rao; J. Reedijk; Jacobus Van Rijn; G. C. Verschoor · Journal of the Chemical Society Dalton Transactions · 1984
The linear quadridentate N2S2 donor ligand 1,7-bis(N-methylbenzimidazol-2′-yl)-2,6-dithiaheptane (bmdhp) forms mono- and di-hydrate 1 : 1 copper(II) complexes which are significantly more stable toward autoreduction th...
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The Iron Cage Revisited: Institutional Isomorphism and Collective Rationality in Organizational Fields
Artículo
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The Iron Cage Revisited: Institutional Isomorphism and Collective Rationality in Organizational Fields
Paul DiMaggio; Walter W. Powell · American Sociological Review · 1983
Instead of examining why organizations are dissimilar, this study explores why organizations tend to be increasingly and inevitably homogenous in their forms and practices. Organizations in a similar line of work are str...
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The protein data bank: A computer-based archival file for macromolecular structures
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The protein data bank: A computer-based archival file for macromolecular structures
F. C. Bernstein; Thomas F. Koetzle; G. J. B. Williams; Edgar F. Meyer; Michael D. Brice; John R. Rodgers; Olga Kennard; Takehiko Shimanouchi · Journal of Molecular Biology · 1977
Materias / palabras clave: Protein Data Bank; Data bank; Data file; National laboratory; File format; Computer science; Scope (computer science); Crystallography; Chemistry; Database; Physics; Protein structure
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Triblock Copolymer Syntheses of Mesoporous Silica with Periodic 50 to 300 Angstrom Pores
Artículo
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Triblock Copolymer Syntheses of Mesoporous Silica with Periodic 50 to 300 Angstrom Pores
Dongyuan Zhao; Jianglin Feng; Qisheng Huo; Nicholas A. Melosh; Glenn H. Fredrickson; Bradley F. Chmelka; Galen D. Stucky · Science · 1998
Use of amphiphilic triblock copolymers to direct the organization of polymerizing silica species has resulted in the preparation of well-ordered hexagonal mesoporous silica structures (SBA-15) with uniform pore sizes up ...
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Two-dimensional atomic crystals
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Two-dimensional atomic crystals
Kostya S. Novoselov; Da Jiang; F. Schedin; Timothy J. Booth; V. V. Khotkevich; С. В. Морозов; A. K. Geǐm · Proceedings of the National Academy of Sciences · 2005
We report free-standing atomic crystals that are strictly 2D and can be viewed as individual atomic planes pulled out of bulk crystals or as unrolled single-wall nanotubes. By using micromechanical cleavage, we have prep...
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Two‐Dimensional Nanocrystals Produced by Exfoliation of Ti<sub>3</sub>AlC<sub>2</sub>
Artículo
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Two‐Dimensional Nanocrystals Produced by Exfoliation of Ti<sub>3</sub>AlC<sub>2</sub>
Michael Naguib; Murat Kurtoglu; Volker Presser; Jun Lu; Junjie Niu; Min Heon; Lars Hultman; Yury Gogotsi · Advanced Materials · 2011
2D Ti3C2 nanosheets, multilayer structures, and conical scrolls produced by room temperature exfoliation of Ti3AlC2 in HF are reported. Since Ti3AlC2 is a member of a 60+ group of layered ternary carbides and nitrides, t...
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<i>Coot</i>: model-building tools for molecular graphics
Artículo
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<i>Coot</i>: model-building tools for molecular graphics
Paul Emsley; Kevin Cowtan · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2004
CCP4mg is a project that aims to provide a general-purpose tool for structural biologists, providing tools for X-ray structure solution, structure comparison and analysis, and publication-quality graphics. The map-fittin...
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<i>EXPGUI</i>, a graphical user interface for<i>GSAS</i>
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<i>EXPGUI</i>, a graphical user interface for<i>GSAS</i>
Brian H. Toby · Journal of Applied Crystallography · 2001
A description and justification of the EXPGUI program is presented. This program implements a graphical user interface and shell for the GSAS single-crystal and Rietveld package. Use of the Tcl/Tk scripting language allo...
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<i>OLEX2</i>: a complete structure solution, refinement and analysis program
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<i>OLEX2</i>: a complete structure solution, refinement and analysis program
Oleg V. Dolomanov; Luc J. Bourhis; Richard J. Gildea; Judith A. K. Howard; Horst Puschmann · Journal of Applied Crystallography · 2009
New software, OLEX2 , has been developed for the determination, visualization and analysis of molecular crystal structures. The software has a portable mouse-driven workflow-oriented and fully comprehensive graphical use...
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<i>WinGX</i>and<i>ORTEP for Windows</i>: an update
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<i>WinGX</i>and<i>ORTEP for Windows</i>: an update
Louis J. Farrugia · Journal of Applied Crystallography · 2012
The WinGX suite provides a complete set of programs for the treatment of small-molecule single-crystal diffraction data, from data reduction and processing, structure solution, model refinement and visualization, and met...
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<i>XDS</i>
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<i>XDS</i>
Wolfgang Kabsch · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2010
The usage and control of recent modifications of the program package XDS for the processing of rotation images are described in the context of previous versions. New features include automatic determination of spot size ...
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A profile refinement method for nuclear and magnetic structures
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A profile refinement method for nuclear and magnetic structures
H. M. Rietveld · Journal of Applied Crystallography · 1969
A structure refinement method is described which does not use integrated neutron powder intensities, single or overlapping, but employs directly the profile intensities obtained from step-scanning measurements of the pow...
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A short history of<i>SHELX</i>
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A short history of<i>SHELX</i>
George M. Sheldrick · Acta Crystallographica Section A Foundations of Crystallography · 2007
An account is given of the development of the SHELX system of computer programs from SHELX-76 to the present day. In addition to identifying useful innovations that have come into general use through their implementation...
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Features and development of <i>Coot</i>
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Features and development of <i>Coot</i>
Paul Emsley; Bernhard Lohkamp; W. G. Scott; Kevin Cowtan · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2010
Coot is a molecular-graphics application for model building and validation of biological macromolecules. The program displays electron-density maps and atomic models and allows model manipulations such as idealization, r...
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MOLSCRIPT: a program to produce both detailed and schematic plots of protein structures
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MOLSCRIPT: a program to produce both detailed and schematic plots of protein structures
P. Kraulis · Journal of Applied Crystallography · 1991
The MOLSCRIPT program produces plots of protein structures using several different kinds of representations. Schematic drawings, simple wire models, ball-and-stick models, CPK models and text labels can be mixed freely. ...
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