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GSVA: gene set variation analysis for microarray and RNA-Seq data
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GSVA: gene set variation analysis for microarray and RNA-Seq data
Sonja Hänzelmann; Robert Castelo; Justin Guinney · BMC Bioinformatics · 2013
BACKGROUND: Gene set enrichment (GSE) analysis is a popular framework for condensing information from gene expression profiles into a pathway or signature summary. The strengths of this approach over single gene analysis...
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Disponible en línea Ficha bibliográfica
RSEM: accurate transcript quantification from RNA-Seq data with or without a reference genome
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RSEM: accurate transcript quantification from RNA-Seq data with or without a reference genome
Bo Li; Colin N. Dewey · BMC Bioinformatics · 2011
BACKGROUND: RNA-Seq is revolutionizing the way transcript abundances are measured. A key challenge in transcript quantification from RNA-Seq data is the handling of reads that map to multiple genes or isoforms. This issu...
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