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5 resultados encontrados.

Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data
Matthew D. Kearse; Richard Moir; Amy Wilson; Steven Stones-Havas; Matthew Cheung; Shane Sturrock; Simon Buxton; Alex Cooper · Bioinformatics · 2012
UNLABELLED: The two main functions of bioinformatics are the organization and analysis of biological data using computational resources. Geneious Basic has been designed to be an easy-to-use and flexible desktop software...
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<tt>edgeR</tt> : a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data
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<tt>edgeR</tt> : a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data
Mark D. Robinson; Davis J. McCarthy; Gordon K. Smyth · Bioinformatics · 2009
SUMMARY: It is expected that emerging digital gene expression (DGE) technologies will overtake microarray technologies in the near future for many functional genomics applications. One of the fundamental data analysis ta...
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HTSeq—a Python framework to work with high-throughput sequencing data
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HTSeq—a Python framework to work with high-throughput sequencing data
Simon Anders; Paul Theodor Pyl; Wolfgang Huber · Bioinformatics · 2014
MOTIVATION: A large choice of tools exists for many standard tasks in the analysis of high-throughput sequencing (HTS) data. However, once a project deviates from standard workflows, custom scripts are needed. RESULTS: W...
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Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data
Artículo
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Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data
Anthony Bolger; Marc Lohse; Björn Usadel · Bioinformatics · 2014
MOTIVATION: Although many next-generation sequencing (NGS) read preprocessing tools already existed, we could not find any tool or combination of tools that met our requirements in terms of flexibility, correct handling ...
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fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor
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fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor
Shifu Chen; Yanqing Zhou; Yaru Chen; Jia Gu · Bioinformatics · 2018
Motivation: Quality control and preprocessing of FASTQ files are essential to providing clean data for downstream analysis. Traditionally, a different tool is used for each operation, such as quality control, adapter tri...
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