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featureCounts: an efficient general purpose program for assigning sequence reads to genomic features
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
featureCounts: an efficient general purpose program for assigning sequence reads to genomic features
Yang Liao; Gordon K. Smyth; Wei Shi · Bioinformatics · 2013
MOTIVATION: Next-generation sequencing technologies generate millions of short sequence reads, which are usually aligned to a reference genome. In many applications, the key information required for downstream analysis i...
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<tt>edgeR</tt> : a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data
Artículo
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<tt>edgeR</tt> : a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data
Mark D. Robinson; Davis J. McCarthy; Gordon K. Smyth · Bioinformatics · 2009
SUMMARY: It is expected that emerging digital gene expression (DGE) technologies will overtake microarray technologies in the near future for many functional genomics applications. One of the fundamental data analysis ta...
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