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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
Zuguang Gu; Roland Eils; Matthias Schlesner · Bioinformatics · 2016
UNLABELLED: Parallel heatmaps with carefully designed annotation graphics are powerful for efficient visualization of patterns and relationships among high dimensional genomic data. Here we present the ComplexHeatmap pac...
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MEGAHIT: an ultra-fast single-node solution for large and complex metagenomics assembly via succinct <i>de Bruijn</i> graph
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MEGAHIT: an ultra-fast single-node solution for large and complex metagenomics assembly via succinct <i>de Bruijn</i> graph
Dinghua Li; Chi-Man Liu; Ruibang Luo; Kunihiko Sadakane; Tak‐Wah Lam · Bioinformatics · 2015
Abstract Summary: MEGAHIT is a NGS de novo assembler for assembling large and complex metagenomics data in a time- and cost-efficient manner. It finished assembling a soil metagenomics dataset with 252 Gbps in 44.1 and 9...
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APE: Analyses of Phylogenetics and Evolution in R language
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APE: Analyses of Phylogenetics and Evolution in R language
Emmanuel Paradis; Julien Claude; Korbinian Strimmer · Bioinformatics · 2004
UNLABELLED: Analysis of Phylogenetics and Evolution (APE) is a package written in the R language for use in molecular evolution and phylogenetics. APE provides both utility functions for reading and writing data and mani...
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