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3 resultados encontrados.

Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data
Anthony Bolger; Marc Lohse; Björn Usadel · Bioinformatics · 2014
MOTIVATION: Although many next-generation sequencing (NGS) read preprocessing tools already existed, we could not find any tool or combination of tools that met our requirements in terms of flexibility, correct handling ...
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fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor
Artículo
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fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor
Shifu Chen; Yanqing Zhou; Yaru Chen; Jia Gu · Bioinformatics · 2018
Motivation: Quality control and preprocessing of FASTQ files are essential to providing clean data for downstream analysis. Traditionally, a different tool is used for each operation, such as quality control, adapter tri...
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MEGAHIT: an ultra-fast single-node solution for large and complex metagenomics assembly via succinct <i>de Bruijn</i> graph
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
MEGAHIT: an ultra-fast single-node solution for large and complex metagenomics assembly via succinct <i>de Bruijn</i> graph
Dinghua Li; Chi-Man Liu; Ruibang Luo; Kunihiko Sadakane; Tak‐Wah Lam · Bioinformatics · 2015
Abstract Summary: MEGAHIT is a NGS de novo assembler for assembling large and complex metagenomics data in a time- and cost-efficient manner. It finished assembling a soil metagenomics dataset with 252 Gbps in 44.1 and 9...
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