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DAVID: Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery
Artículo
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DAVID: Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery
Glynn Dennis; Brad T. Sherman; Douglas A Hosack; Jun Yang; Wei Gao; H. Clifford Lane; Richard A. Lempicki · Genome biology · 2003
BACKGROUND: Functional annotation of differentially expressed genes is a necessary and critical step in the analysis of microarray data. The distributed nature of biological knowledge frequently requires researchers to n...
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Model-based Analysis of ChIP-Seq (MACS)
Artículo
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Model-based Analysis of ChIP-Seq (MACS)
Yong Zhang; Tao Liu; Clifford A. Meyer; Jérôme Eeckhoute; David S. Johnson; B Bernstein; Chad Nusbaum; R Myers · Genome biology · 2008
We present Model-based Analysis of ChIP-Seq data, MACS, which analyzes data generated by short read sequencers such as Solexa's Genome Analyzer. MACS empirically models the shift size of ChIP-Seq tags, and uses it to imp...
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