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3 resultados encontrados.

Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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CHARMM‐GUI: A web‐based graphical user interface for CHARMM
Artículo
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CHARMM‐GUI: A web‐based graphical user interface for CHARMM
Sunhwan Jo; Taehoon Kim; Vidyashankara Iyer; Wonpil Im · Journal of Computational Chemistry · 2008
CHARMM is an academic research program used widely for macromolecular mechanics and dynamics with versatile analysis and manipulation tools of atomic coordinates and dynamics trajectories. CHARMM-GUI, http://www.charmm-g...
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AutoDock4 and AutoDockTools4: Automated docking with selective receptor flexibility
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AutoDock4 and AutoDockTools4: Automated docking with selective receptor flexibility
Garrett M. Morris; Ruth Huey; William Lindstrom; Michel F. Sanner; Richard K. Belew; David S. Goodsell; Arthur J. Olson · Journal of Computational Chemistry · 2009
We describe the testing and release of AutoDock4 and the accompanying graphical user interface AutoDockTools. AutoDock4 incorporates limited flexibility in the receptor. Several tests are reported here, including a redoc...
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Scalable molecular dynamics with NAMD
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Scalable molecular dynamics with NAMD
J. C. Phillips; Rosemary Braun; Wei Wang; James C. Gumbart; Emad Tajkhorshid; Elizabeth Villa; Christophe Chipot; Robert D. Skeel · Journal of Computational Chemistry · 2005
NAMD is a parallel molecular dynamics code designed for high-performance simulation of large biomolecular systems. NAMD scales to hundreds of processors on high-end parallel platforms, as well as tens of processors on lo...
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