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phyloseq: An R Package for Reproducible Interactive Analysis and Graphics of Microbiome Census Data
Artículo
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phyloseq: An R Package for Reproducible Interactive Analysis and Graphics of Microbiome Census Data
Paul J. McMurdie; Susan Holmes · PLoS ONE · 2013
BACKGROUND: the analysis of microbial communities through dna sequencing brings many challenges: the integration of different types of data with methods from ecology, genetics, phylogenetics, multivariate statistics, vis...
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Pilon: An Integrated Tool for Comprehensive Microbial Variant Detection and Genome Assembly Improvement
Artículo
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Pilon: An Integrated Tool for Comprehensive Microbial Variant Detection and Genome Assembly Improvement
Bruce J. Walker; Thomas Abeel; Terrance Shea; Margaret Priest; Amr Abouelliel; Sharadha Sakthikumar; Christina A. Cuomo; Qiandong Zeng · PLoS ONE · 2014
Advances in modern sequencing technologies allow us to generate sufficient data to analyze hundreds of bacterial genomes from a single machine in a single day. This potential for sequencing massive numbers of genomes cal...
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