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Integrative Analysis of Complex Cancer Genomics and Clinical Profiles Using the cBioPortal
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Integrative Analysis of Complex Cancer Genomics and Clinical Profiles Using the cBioPortal
Jianjiong Gao; Bülent Arman Aksoy; Uğur Doğrusöz; Gideon Dresdner; Benjamin Groß; S. Onur Sumer; Yichao Sun; Anders J. Skanderup · Science Signaling · 2013
The cBioPortal for Cancer Genomics (http://cbioportal.org) provides a Web resource for exploring, visualizing, and analyzing multidimensional cancer genomics data. The portal reduces molecular profiling data from cancer ...
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TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions
Artículo
Página del recurso disponible Artículo OpenAlex
TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions
Daehwan Kim; Geo Pertea; Cole Trapnell; Harold Pimentel; Ryan Kelley; Steven L. Salzberg · Genome biology · 2013
TopHat is a popular spliced aligner for RNA-sequence (RNA-seq) experiments. In this paper, we describe TopHat2, which incorporates many significant enhancements to TopHat. TopHat2 can align reads of various lengths produ...
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