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Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome
Artículo
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Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome
Manfred Grabherr; Brian J. Haas; Moran Yassour; Joshua Z. Levin; Dawn Thompson; Ido Amit; Xian Adiconis; Lin Fan · Nature Biotechnology · 2011
Materias / palabras clave: Genome; Reference genome; Biology; De novo transcriptome assembly; Computational biology; Sequence assembly; Transcriptome; Massive parallel sequencing; Deep sequencing; Genetics; RNA-Seq; Gene
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FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies
Artículo
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FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies
Tanja Magoč; Steven L. Salzberg · Bioinformatics · 2011
MOTIVATION: Next-generation sequencing technologies generate very large numbers of short reads. Even with very deep genome coverage, short read lengths cause problems in de novo assemblies. The use of paired-end librarie...
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