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Manual de prácticas de Bioinformática
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Manual de prácticas de Bioinformática
Capel Salinas, Juan · Editorial Universidad de Almería · 2016 · ISBN 9788416642342
Materias / palabras clave: Bioinformatics; Bioinformática
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Institucional
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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
Artículo
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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
Zuguang Gu; Roland Eils; Matthias Schlesner · Bioinformatics · 2016
UNLABELLED: Parallel heatmaps with carefully designed annotation graphics are powerful for efficient visualization of patterns and relationships among high dimensional genomic data. Here we present the ComplexHeatmap pac...
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Material complementario
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MultiQC: summarize analysis results for multiple tools and samples in a single report
Artículo
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MultiQC: summarize analysis results for multiple tools and samples in a single report
Philip Ewels; Måns Magnusson; Sverker Lundin; Max Käller · Bioinformatics · 2016
MOTIVATION: Fast and accurate quality control is essential for studies involving next-generation sequencing data. Whilst numerous tools exist to quantify QC metrics, there is no common approach to flexibly integrate thes...
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The Ensembl Variant Effect Predictor
Artículo
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The Ensembl Variant Effect Predictor
William McLaren; Laurent Gil; Sarah Hunt; Harpreet Singh Riat; Graham R. S. Ritchie; Anja Thormann; Paul Flicek; Fiona Cunningham · Genome biology · 2016
The Ensembl Variant Effect Predictor is a powerful toolset for the analysis, annotation, and prioritization of genomic variants in coding and non-coding regions. It provides access to an extensive collection of genomic a...
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deepTools2: a next generation web server for deep-sequencing data analysis
Artículo
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deepTools2: a next generation web server for deep-sequencing data analysis
Fidel Ramírez; Devon Ryan; Björn Grüning; Vivek Bhardwaj; Fabian Kilpert; Andreas S. Richter; Steffen Heyne; Friederike Dündar · Nucleic Acids Research · 2016
We present an update to our Galaxy-based web server for processing and visualizing deeply sequenced data. Its core tool set, deepTools, allows users to perform complete bioinformatic workflows ranging from quality contro...
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