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11 resultados encontrados.

Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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Integrative Analysis of Complex Cancer Genomics and Clinical Profiles Using the cBioPortal
Artículo
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Integrative Analysis of Complex Cancer Genomics and Clinical Profiles Using the cBioPortal
Jianjiong Gao; Bülent Arman Aksoy; Uğur Doğrusöz; Gideon Dresdner; Benjamin Groß; S. Onur Sumer; Yichao Sun; Anders J. Skanderup · Science Signaling · 2013
The cBioPortal for Cancer Genomics (http://cbioportal.org) provides a Web resource for exploring, visualizing, and analyzing multidimensional cancer genomics data. The portal reduces molecular profiling data from cancer ...
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The cBio Cancer Genomics Portal: An Open Platform for Exploring Multidimensional Cancer Genomics Data
Artículo
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The cBio Cancer Genomics Portal: An Open Platform for Exploring Multidimensional Cancer Genomics Data
Ethan Cerami; Jianjiong Gao; Uğur Doğrusöz; Benjamin Groß; S. Onur Sumer; Bülent Arman Aksoy; Anders J. Skanderup; Caitlin J. Byrne · Cancer Discovery · 2012
The cBio Cancer Genomics Portal (http://cbioportal.org) is an open-access resource for interactive exploration of multidimensional cancer genomics data sets, currently providing access to data from more than 5,000 tumor ...
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Metagenomic biomarker discovery and explanation
Artículo
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Metagenomic biomarker discovery and explanation
Nicola Segata; Jacques Izard; Levi Waldron; Dirk Gevers; Larisa Miropolsky; Wendy S. Garrett; Curtis Huttenhower · Genome biology · 2011
This study describes and validates a new method for metagenomic biomarker discovery by way of class comparison, tests of biological consistency and effect size estimation. This addresses the challenge of finding organism...
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BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs
Artículo
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BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs
Felipe A. Simão; Robert M. Waterhouse; Panagiotis Ioannidis; Evgenia V. Kriventseva; Evgeny M. Zdobnov · Bioinformatics · 2015
MOTIVATION: Genomics has revolutionized biological research, but quality assessment of the resulting assembled sequences is complicated and remains mostly limited to technical measures like N50. RESULTS: We propose a mea...
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Integrated analysis of multimodal single-cell data
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Integrated analysis of multimodal single-cell data
Yuhan Hao; Stephanie Hao; Erica Andersen‐Nissen; William M. Mauck; Shiwei Zheng; Andrew Butler; Madeline J. Lee; Aaron J. Wilk · Cell · 2021
The simultaneous measurement of multiple modalities represents an exciting frontier for single-cell genomics and necessitates computational methods that can define cellular states based on multimodal data. Here, we intro...
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The Cancer Genome Atlas Pan-Cancer analysis project
Artículo
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The Cancer Genome Atlas Pan-Cancer analysis project
John N. Weinstein; Eric A Collisson; Gordon B. Mills; Kenna Shaw; Brad Ozenberger; Kyle Ellrott; Ilya Shmulevich; Chris Sander · Nature Genetics · 2013
Current clinical practice is organized according to tissue or organ of origin of tumors. Now, The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network has started to identify genomic and other molecular commonalities among a doze...
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The Ensembl Variant Effect Predictor
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The Ensembl Variant Effect Predictor
William McLaren; Laurent Gil; Sarah Hunt; Harpreet Singh Riat; Graham R. S. Ritchie; Anja Thormann; Paul Flicek; Fiona Cunningham · Genome biology · 2016
The Ensembl Variant Effect Predictor is a powerful toolset for the analysis, annotation, and prioritization of genomic variants in coding and non-coding regions. It provides access to an extensive collection of genomic a...
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<tt>edgeR</tt> : a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data
Artículo
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<tt>edgeR</tt> : a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data
Mark D. Robinson; Davis J. McCarthy; Gordon K. Smyth · Bioinformatics · 2009
SUMMARY: It is expected that emerging digital gene expression (DGE) technologies will overtake microarray technologies in the near future for many functional genomics applications. One of the fundamental data analysis ta...
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Computational and Structural Biotechnology Journal
Artículo
Acceso abierto Artículo DOAJ
Computational and Structural Biotechnology Journal
Elsevier; Netherlands · ISSN 2001-0370
Materias / palabras clave: systems biology, bioinformatics, computational chemistry, drug discovery, genomics, proteomics; Technology: Chemical technology: Biotechnology
Idioma English
Acceso abiertoRuta libre sin proxy. Acceso recomendado cuando no hay suscripción activa.
Open Access
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Genomics
Artículo
Acceso abierto Artículo DOAJ
Genomics
Elsevier; United States · ISSN 0888-7543
Materias / palabras clave: genome sequencing and analysis, functional genomics, comparative and evolutionary genomics, bioinformatics and computational genomics, regulatory and epigenomic genomics, genomic methods and technology development; Scien...
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Open Access
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Journal of Bioinformatics and Genomics
Artículo
Acceso abierto Artículo DOAJ
Journal of Bioinformatics and Genomics
Cifra Publishing House; Spain · ISSN 2530-1381
Materias / palabras clave: bioinformatics, computational biology, genomics, gene expression, genetic and population analysis, data and text mining; Science: Biology (General): Genetics
Idioma Russian, English
Acceso abiertoRuta libre sin proxy. Acceso recomendado cuando no hay suscripción activa.
Open Access
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