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51 resultados encontrados.

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Nemesis: A multi-scale, multi-physics algorithm for astrophysics
Artículo
Acceso abierto Artículo DOAJ
Nemesis: A multi-scale, multi-physics algorithm for astrophysics
Hochart E. et al · EDP Sciences · 2026 · ISSN 0004-6361
Context. Astronomical environments are governed by a complex interplay of physical processes, including gravitational dynamics, radiative transfer, stellar evolution, chemistry, and hydrodynamics. These processes span a ...
LCC TENDOkFzdHJvbm9teQ~~Idioma eng
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Open Access
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Quantum Computing and Quantum Technologies in Drug Discovery and Therapeutics: Evidence, Benchmarking, and Translational Integration
Artículo
Acceso abierto Artículo DOAJ
Quantum Computing and Quantum Technologies in Drug Discovery and Therapeutics: Evidence, Benchmarking, and Translational Integration
Niazi SK · Dove Medical Press · 2026 · ISSN 1177-8881
Sarfaraz K Niazi Department of Pharmaceutical Sciences, University of Illinois, Chicago, IL, 60612, USACorrespondence: Sarfaraz K Niazi, Email sniazi3@uic.eduAbstract: Quantum technologies—quantum computing, quantum se...
LCC LCC:Therapeutics. PharmacologyIdioma eng
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SOFTWARE IMPLEMENTATION OF ALGORITHMS FOR CALCULATING PEARSON, SPEARMAN AND KENDALL CORRELATIONS IN C#: ПРОГРАМНА РЕАЛІЗАЦІЯ НА МОВІ C# АЛГОРИТМІВ ОБЧИСЛЕННЯ КОРЕЛЯЦІЇ ПІРСОНА, СПІРМЕНА І КЕНДАЛЛА
Artículo
Material complementario disponible Artículo DOAJ
SOFTWARE IMPLEMENTATION OF ALGORITHMS FOR CALCULATING PEARSON, SPEARMAN AND KENDALL CORRELATIONS IN C#: ПРОГРАМНА РЕАЛІЗАЦІЯ НА МОВІ C# АЛГОРИТМІВ ОБЧИСЛЕННЯ КОРЕЛЯЦІЇ ПІРСОНА, СПІРМЕНА І КЕНДАЛЛА
Vitalii Bazurin et al · Sumy State Pedagogical University named after A.S. Makarenko · 2026 · ISSN 2413-1571
Formulation of the problem. In scientific research in sociology, education, physics, chemistry and other sciences, methods of correlation analysis are used. Correlation coefficients are used to determine the existence of...
LCC TENDOlNwZWNpYWwgYXNwZWN0cyBvZiBlZHVjYXRpb24~Idioma eng
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Bionanotecnología en Santiago del Estero
Artículo
Acceso abierto Artículo CONICET Digital
Bionanotecnología en Santiago del Estero
Coria, Maria Sumampa et al · Asociación Argentina para el Progreso de las Ciencias · 2023 · ISSN 0009-6733
La integración entre biotecnología y nanotecnología conforma la bionanotecnología que es una disciplina que permite potenciar la utilización de biomoléculas con materiales abióticos de diseño a escala nanométric...
Idioma spa
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Computational Quantum Physics and Chemistry of Nanomaterials
Libro electrónico
Material complementario disponible Libro electrónico DOAB
Computational Quantum Physics and Chemistry of Nanomaterials
MDPI - Multidisciplinary Digital Publishing Institute · ISBN 9783036501345;9783036501352
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Material complementario
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Chemistry with ADF
Artículo
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Chemistry with ADF
G. te Velde; F. Matthias Bickelhaupt; Evert Jan Baerends; Célia Fonseca Guerra; S. J. A. van Gisbergen; J. G. Snijders; Tom Ziegler · Journal of Computational Chemistry · 2001
Abstract We present the theoretical and technical foundations of the Amsterdam Density Functional (ADF) program with a survey of the characteristics of the code (numerical integration, density fitting for the Coulomb pot...
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Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings
Artículo
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Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings
Christopher A. Lipinski; Franco Lombardo; Beryl W. Dominy; Paul J. Feeney · Advanced Drug Delivery Reviews · 1997
Materias / palabras clave: Solubility; Drug discovery; Chemistry; Thermodynamics; Permeability (electromagnetism); Hildebrand solubility parameter; Permeation; Work (physics); Computational chemistry; Organic chemistry; Physics; Membrane
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The M06 suite of density functionals for main group thermochemistry, thermochemical kinetics, noncovalent interactions, excited states, and transition elements: two new functionals and systematic testing of four M06-class functionals and 12 other functionals
Artículo
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The M06 suite of density functionals for main group thermochemistry, thermochemical kinetics, noncovalent interactions, excited states, and transition elements: two new functionals and systematic testing of four M06-class functionals and 12 other functionals
Yan Zhao; Donald G. Truhlar · Theoretical Chemistry Accounts · 2007
We present two new hybrid meta exchange- correlation functionals, called M06 and M06-2X. The M06 functional is parametrized including both transition metals and nonmetals, whereas the M06-2X functional is a high-nonlocal...
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Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings 1PII of original article: S0169-409X(96)00423-1. The article was originally published in Advanced Drug Delivery Reviews 23 (1997) 3–25. 1
Texto / recurso
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Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings 1PII of original article: S0169-409X(96)00423-1. The article was originally published in Advanced Drug Delivery Reviews 23 (1997) 3–25. 1
Christopher A. Lipinski; Franco Lombardo; Beryl W. Dominy; Paul J. Feeney · Advanced Drug Delivery Reviews · 2001
Materias / palabras clave: Solubility; Drug discovery; Thermodynamics; Chemistry; Permeability (electromagnetism); Computational chemistry; Physics; Organic chemistry; Membrane; Biochemistry
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SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules
Artículo
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SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules
Antoine Daina; Olivier Michielin; Vincent Zoete · Scientific Reports · 2017
To be effective as a drug, a potent molecule must reach its target in the body in sufficient concentration, and stay there in a bioactive form long enough for the expected biologic events to occur. Drug development invol...
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All-Atom Empirical Potential for Molecular Modeling and Dynamics Studies of Proteins
Artículo
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All-Atom Empirical Potential for Molecular Modeling and Dynamics Studies of Proteins
Alexander D. MacKerell; Donald Bashford; M. Bellott; Roland L. Dunbrack; Jeffrey D. Evanseck; Martin J. Field; Stefan Fischer; Jun Gao · The Journal of Physical Chemistry B · 1998
New protein parameters are reported for the all-atom empirical energy function in the CHARMM program. The parameter evaluation was based on a self-consistent approach designed to achieve a balance between the internal (b...
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COSMO: a new approach to dielectric screening in solvents with explicit expressions for the screening energy and its gradient
Artículo
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COSMO: a new approach to dielectric screening in solvents with explicit expressions for the screening energy and its gradient
Andreas Klamt; Gerrit Schüürmann · Journal of the Chemical Society Perkin Transactions 2 · 1993
Starting from the screening in conductors, an algorithm for the accurate calculation of dielectric screening effects in solvents is presented, which leads to rather simple explicit expressions for the screening energy an...
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A consistent and accurate<i>ab initio</i>parametrization of density functional dispersion correction (DFT-D) for the 94 elements H-Pu
Artículo
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A consistent and accurate<i>ab initio</i>parametrization of density functional dispersion correction (DFT-D) for the 94 elements H-Pu
Stefan Grimme; Jens Antony; Stephan Ehrlich; Helge Krieg · The Journal of Chemical Physics · 2010
The method of dispersion correction as an add-on to standard Kohn-Sham density functional theory (DFT-D) has been refined regarding higher accuracy, broader range of applicability, and less empiricism. The main new ingre...
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A new mixing of Hartree–Fock and local density-functional theories
Artículo
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A new mixing of Hartree–Fock and local density-functional theories
Axel D. Becke · The Journal of Chemical Physics · 1993
Previous attempts to combine Hartree–Fock theory with local density-functional theory have been unsuccessful in applications to molecular bonding. We derive a new coupling of these two theories that maintains their sim...
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GROMACS 4: Algorithms for Highly Efficient, Load-Balanced, and Scalable Molecular Simulation
Artículo
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GROMACS 4: Algorithms for Highly Efficient, Load-Balanced, and Scalable Molecular Simulation
Berk Hess; Carsten Kutzner; David van der Spoel; Erik Lindahl · Journal of Chemical Theory and Computation · 2008
Molecular simulation is an extremely useful, but computationally very expensive tool for studies of chemical and biomolecular systems. Here, we present a new implementation of our molecular simulation toolkit GROMACS whi...
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General atomic and molecular electronic structure system
Artículo
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General atomic and molecular electronic structure system
Michael W. Schmidt; Kim K. Baldridge; Jerry A. Boatz; Stephen T. Elbert; Mark S. Gordon; Jan H. Jensen; Shiro Koseki; Nikita Matsunaga · Journal of Computational Chemistry · 1993
Abstract A description of the ab initio quantum chemistry package GAMESS is presented. Chemical systems containing atoms through radon can be treated with wave functions ranging from the simplest closed‐shell case up t...
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Quantum Calculation of Molecular Energies and Energy Gradients in Solution by a Conductor Solvent Model
Artículo
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Quantum Calculation of Molecular Energies and Energy Gradients in Solution by a Conductor Solvent Model
Vincenzo Barone; Maurizio Cossi · The Journal of Physical Chemistry A · 1998
A new implementation of the conductor-like screening solvation model (COSMO) in the GAUSSIAN94 package is presented. It allows Hartree−Fock (HF), density functional (DF) and post-HF energy, and HF and DF gradient calcu...
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ff14SB: Improving the Accuracy of Protein Side Chain and Backbone Parameters from ff99SB
Artículo
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ff14SB: Improving the Accuracy of Protein Side Chain and Backbone Parameters from ff99SB
James Maier; Carmenza Martinez; Koushik Kasavajhala; Lauren Wickstrom; Kevin Hauser; Carlos Simmerling · Journal of Chemical Theory and Computation · 2015
Molecular mechanics is powerful for its speed in atomistic simulations, but an accurate force field is required. The Amber ff99SB force field improved protein secondary structure balance and dynamics from earlier force f...
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A fast and robust algorithm for Bader decomposition of charge density
Artículo
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A fast and robust algorithm for Bader decomposition of charge density
Graeme Henkelman; Andri Arnaldsson; Hannes Jónsson · Computational Materials Science · 2005
Materias / palabras clave: Charge density; Charge (physics); Cluster (spacecraft); Atom (system on chip); Grid; Crystal (programming language); Point particle; Atoms in molecules; Algorithm; Chemistry; Molecule; Topology (electrical circuits)
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Avogadro: an advanced semantic chemical editor, visualization, and analysis platform
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Avogadro: an advanced semantic chemical editor, visualization, and analysis platform
Marcus D. Hanwell; Donald Curtis; David Lonie; Tim Vandermeersch; Eva Zurek; Geoffrey Hutchison · Journal of Cheminformatics · 2012
BACKGROUND: The Avogadro project has developed an advanced molecule editor and visualizer designed for cross-platform use in computational chemistry, molecular modeling, bioinformatics, materials science, and related are...
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<scp>CHARMM</scp>: A program for macromolecular energy, minimization, and dynamics calculations
Artículo
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<scp>CHARMM</scp>: A program for macromolecular energy, minimization, and dynamics calculations
Bernard R. Brooks; Robert E. Bruccoleri; Barry D. Olafson; David J. States; S. Swaminathan; Martin Karplus · Journal of Computational Chemistry · 1983
Abstract CHARMM ( C hemistry at HAR vard M acromolecular M echanics) is a highly flexible computer program which uses empirical energy functions to model macromolecular systems. The program can read or model build struct...
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Balanced basis sets of split valence, triple zeta valence and quadruple zeta valence quality for H to Rn: Design and assessment of accuracy
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Balanced basis sets of split valence, triple zeta valence and quadruple zeta valence quality for H to Rn: Design and assessment of accuracy
Florian Weigend; Reinhart Ahlrichs · Physical Chemistry Chemical Physics · 2005
Gaussian basis sets of quadruple zeta valence quality for Rb-Rn are presented, as well as bases of split valence and triple zeta valence quality for H-Rn. The latter were obtained by (partly) modifying bases developed pr...
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Density-functional thermochemistry. III. The role of exact exchange
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Density-functional thermochemistry. III. The role of exact exchange
Axel D. Becke · The Journal of Chemical Physics · 1993
Despite the remarkable thermochemical accuracy of Kohn–Sham density-functional theories with gradient corrections for exchange-correlation [see, for example, A. D. Becke, J. Chem. Phys. 96, 2155 (1992)], we believe tha...
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Development and Testing of the OPLS All-Atom Force Field on Conformational Energetics and Properties of Organic Liquids
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Development and Testing of the OPLS All-Atom Force Field on Conformational Energetics and Properties of Organic Liquids
William L. Jorgensen; David S. Maxwell; Julian Tirado‐Rives · Journal of the American Chemical Society · 1996
The parametrization and testing of the OPLS all-atom force field for organic molecules and peptides are described. Parameters for both torsional and nonbonded energetics have been derived, while the bond stretching and a...
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