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Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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trimAl: a tool for automated alignment trimming in large-scale phylogenetic analyses
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
trimAl: a tool for automated alignment trimming in large-scale phylogenetic analyses
Salvador Capella-Gutiérrez; José M. Silla-Martínez; Toni Gabaldón · Bioinformatics · 2009
SUMMARY: Multiple sequence alignments are central to many areas of bioinformatics. It has been shown that the removal of poorly aligned regions from an alignment increases the quality of subsequent analyses. Such an alig...
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P<scp>ACKMOL</scp>: A package for building initial configurations for molecular dynamics simulations
Artículo
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P<scp>ACKMOL</scp>: A package for building initial configurations for molecular dynamics simulations
Leandro Martı́nez; Ricardo Andrade; Ernesto G. Birgin; J. M. Martı́nez · Journal of Computational Chemistry · 2009
Adequate initial configurations for molecular dynamics simulations consist of arrangements of molecules distributed in space in such a way to approximately represent the system's overall structure. In order that the simu...
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Disponible en línea Ficha bibliográfica
AutoDock Vina: Improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization, and multithreading
Artículo
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AutoDock Vina: Improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization, and multithreading
Oleg Trott; Arthur J. Olson · Journal of Computational Chemistry · 2009
AutoDock Vina, a new program for molecular docking and virtual screening, is presented. AutoDock Vina achieves an approximately two orders of magnitude speed-up compared with the molecular docking software previously dev...
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