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limma powers differential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies
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limma powers differential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies
Matthew E. Ritchie; Belinda Phipson; Di Wu; Yifang Hu; Charity W. Law; Wei Shi; Gordon K. Smyth · Nucleic Acids Research · 2015
limma is an R/Bioconductor software package that provides an integrated solution for analysing data from gene expression experiments. It contains rich features for handling complex experimental designs and for informatio...
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GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers
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GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers
M Abraham; Teemu J. Murtola; Roland Schulz; Szilárd Páll; Jeremy C. Smith; Berk Hess; Erik Lindahl · SoftwareX · 2015
GROMACS is one of the most widely used open-source and free software codes in chemistry, used primarily for dynamical simulations of biomolecules. It provides a rich set of calculation types, preparation and analysis too...
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