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4 resultados encontrados.

Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies
Tanja Magoč; Steven L. Salzberg · Bioinformatics · 2011
MOTIVATION: Next-generation sequencing technologies generate very large numbers of short reads. Even with very deep genome coverage, short read lengths cause problems in de novo assemblies. The use of paired-end librarie...
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Material complementario
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RSEM: accurate transcript quantification from RNA-Seq data with or without a reference genome
Artículo
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RSEM: accurate transcript quantification from RNA-Seq data with or without a reference genome
Bo Li; Colin N. Dewey · BMC Bioinformatics · 2011
BACKGROUND: RNA-Seq is revolutionizing the way transcript abundances are measured. A key challenge in transcript quantification from RNA-Seq data is the handling of reads that map to multiple genes or isoforms. This issu...
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Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome
Artículo
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Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome
Manfred Grabherr; Brian J. Haas; Moran Yassour; Joshua Z. Levin; Dawn Thompson; Ido Amit; Xian Adiconis; Lin Fan · Nature Biotechnology · 2011
Materias / palabras clave: Genome; Reference genome; Biology; De novo transcriptome assembly; Computational biology; Sequence assembly; Transcriptome; Massive parallel sequencing; Deep sequencing; Genetics; RNA-Seq; Gene
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Integrative genomics viewer
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Integrative genomics viewer
James Robinson; Helga Thorvaldsdóttir; Wendy Winckler; Mitchell Guttman; Eric S. Lander; Gad Getz; Jill P. Mesirov · Nature Biotechnology · 2011
Materias / palabras clave: Genomics; Computational biology; Profiling (computer programming); Human genome; Genome; Exome sequencing; Biology; Exome; Visualization; Genome browser; Data science; Computer science
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