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Model-based Analysis of ChIP-Seq (MACS)
Artículo
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Model-based Analysis of ChIP-Seq (MACS)
Yong Zhang; Tao Liu; Clifford A. Meyer; Jérôme Eeckhoute; David S. Johnson; B Bernstein; Chad Nusbaum; R Myers · Genome biology · 2008
We present Model-based Analysis of ChIP-Seq data, MACS, which analyzes data generated by short read sequencers such as Solexa's Genome Analyzer. MACS empirically models the shift size of ChIP-Seq tags, and uses it to imp...
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The RAST Server: Rapid Annotations using Subsystems Technology
Artículo
Texto completo disponible Artículo OpenAlex
The RAST Server: Rapid Annotations using Subsystems Technology
Ramy K. Aziz; Daniela Bartels; Aaron A. Best; Matthew DeJongh; T. Disz; Robert A. Edwards; Kevin Formsma; Svetlana Gerdes · BMC Genomics · 2008
BACKGROUND: The number of prokaryotic genome sequences becoming available is growing steadily and is growing faster than our ability to accurately annotate them. DESCRIPTION: We describe a fully automated service for ann...
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