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MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11
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MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11
Koichiro Tamura; Glen Stecher; Sudhir Kumar · Molecular Biology and Evolution · 2021
Abstract The Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software has matured to contain a large collection of methods and tools of computational molecular evolution. Here, we describe new additions that make MEGA a ...
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LAMMPS - a flexible simulation tool for particle-based materials modeling at the atomic, meso, and continuum scales
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LAMMPS - a flexible simulation tool for particle-based materials modeling at the atomic, meso, and continuum scales
Aidan P. Thompson; Hasan Metin Aktulga; Richard Berger; Dan Bolintineanu; William M. Brown; Paul Crozier; Pieter J. in ’t Veld; Axel Kohlmeyer · Computer Physics Communications · 2021
Since the classical molecular dynamics simulator LAMMPS was released as an open source code in 2004, it has become a widely-used tool for particle-based modeling of materials at length scales ranging from atomic to mesos...
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clusterProfiler 4.0: A universal enrichment tool for interpreting omics data
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clusterProfiler 4.0: A universal enrichment tool for interpreting omics data
Tianzhi Wu; Erqiang Hu; Shuangbin Xu; Meijun Chen; Pingfan Guo; Zehan Dai; Tingze Feng; Lang Zhou · The Innovation · 2021
packages to offer tidy interfaces for data operation and visualization. Other new features include gene set enrichment analysis and comparison of enrichment results from multiple gene lists. We anticipate that clusterPro...
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