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phyloseq: An R Package for Reproducible Interactive Analysis and Graphics of Microbiome Census Data
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
phyloseq: An R Package for Reproducible Interactive Analysis and Graphics of Microbiome Census Data
Paul J. McMurdie; Susan Holmes · PLoS ONE · 2013
BACKGROUND: the analysis of microbial communities through dna sequencing brings many challenges: the integration of different types of data with methods from ecology, genetics, phylogenetics, multivariate statistics, vis...
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Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome
Artículo
Página del recurso disponible Artículo OpenAlex
Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome
Lawrence A. David; Corinne F. Maurice; Rachel N. Carmody; David B. Gootenberg; Julie E. Button; Benjamin E. Wolfe; Alisha V. Ling; A. Sloan Devlin · Nature · 2013
Materias / palabras clave: Biology; Ruminococcus; Microbiome; Bacteroides; Firmicutes; Gut flora; Microorganism; Roseburia; Microbial ecology; Microbiology; Food science; Bacteria
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Predictive functional profiling of microbial communities using 16S rRNA marker gene sequences
Artículo
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Predictive functional profiling of microbial communities using 16S rRNA marker gene sequences
Morgan G. I. Langille; Jesse Zaneveld; J. Gregory Caporaso; Daniel McDonald; Dan Knights; Joshua A Reyes; José C. Clemente; Deron E. Burkepile · Nature Biotechnology · 2013
Materias / palabras clave: Metagenomics; Biology; Phylogenetic tree; 16S ribosomal RNA; Gene; Computational biology; Phylogenetics; Microbiome; Genetics; Ribosomal RNA; Genome; Evolutionary biology
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