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7 resultados encontrados.

Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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Gephi: An Open Source Software for Exploring and Manipulating Networks
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Gephi: An Open Source Software for Exploring and Manipulating Networks
Mathieu Bastian; Sébastien Heymann; Mathieu Jacomy · Proceedings of the International AAAI Conference on Web and Social Media · 2009
Gephi is an open source software for graph and network analysis. It uses a 3D render engine to display large networks in real-time and to speed up the exploration. A flexible and multi-task architecture brings new possib...
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QUANTUM ESPRESSO: a modular and open-source software project for quantum simulations of materials
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QUANTUM ESPRESSO: a modular and open-source software project for quantum simulations of materials
Paolo Giannozzi; Stefano Baroni; Nicola Bonini; Matteo Calandra; Roberto Car; Carlo Cavazzoni; Davide Ceresoli; G. Chiarotti · Journal of Physics Condensed Matter · 2009
QUANTUM ESPRESSO is an integrated suite of computer codes for electronic-structure calculations and materials modeling, based on density-functional theory, plane waves, and pseudopotentials (norm-conserving, ultrasoft, a...
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Introducing mothur: Open-Source, Platform-Independent, Community-Supported Software for Describing and Comparing Microbial Communities
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Introducing mothur: Open-Source, Platform-Independent, Community-Supported Software for Describing and Comparing Microbial Communities
Patrick D. Schloss; Sarah L. Westcott; Thomas Ryabin; Justine R. Hall; Martin Hartmann; Emily B. Hollister; Ryan A. Lesniewski; Brian B. Oakley · Applied and Environmental Microbiology · 2009
mothur aims to be a comprehensive software package that allows users to use a single piece of software to analyze community sequence data. It builds upon previous tools to provide a flexible and powerful software package...
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The WEKA data mining software
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The WEKA data mining software
Mark Hall; Eibe Frank; Geoffrey Holmes; Bernhard Pfahringer; Peter Reutemann; Ian H. Witten · ACM SIGKDD Explorations Newsletter · 2009
More than twelve years have elapsed since the first public release of WEKA. In that time, the software has been rewritten entirely from scratch, evolved substantially and now accompanies a text on data mining [35]. These...
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Visualization and analysis of atomistic simulation data with OVITO–the Open Visualization Tool
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Visualization and analysis of atomistic simulation data with OVITO–the Open Visualization Tool
Alexander Stukowski · Modelling and Simulation in Materials Science and Engineering · 2009
The Open Visualization Tool (OVITO) is a new 3D visualization software designed for post-processing atomistic data obtained from molecular dynamics or Monte Carlo simulations. Unique analysis, editing and animations func...
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Fast and accurate short read alignment with Burrows–Wheeler transform
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Fast and accurate short read alignment with Burrows–Wheeler transform
Heng Li; Richard Durbin · Bioinformatics · 2009
MOTIVATION: The enormous amount of short reads generated by the new DNA sequencing technologies call for the development of fast and accurate read alignment programs. A first generation of hash table-based methods has be...
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TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq
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TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq
Cole Trapnell; Lior Pachter; Steven L. Salzberg · Bioinformatics · 2009
MOTIVATION: A new protocol for sequencing the messenger RNA in a cell, known as RNA-Seq, generates millions of short sequence fragments in a single run. These fragments, or 'reads', can be used to measure levels of gene ...
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