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3 resultados encontrados.

Tipos de recurso: Libro electrónico Artículo Revista Tesis Capítulo
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CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data
Artículo
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CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data
LiMin Fu; Beifang Niu; Zhengwei Zhu; Sitao Wu; Weizhong Li · Bioinformatics · 2012
SUMMARY: CD-HIT is a widely used program for clustering biological sequences to reduce sequence redundancy and improve the performance of other sequence analyses. In response to the rapid increase in the amount of sequen...
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SPAdes: A New Genome Assembly Algorithm and Its Applications to Single-Cell Sequencing
Artículo
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SPAdes: A New Genome Assembly Algorithm and Its Applications to Single-Cell Sequencing
Anton Bankevich; Sergey Nurk; Dmitry Antipov; Alexey Gurevich; Mikhail Dvorkin; Alexander S. Kulikov; Valery M. Lesin; Sergey Nikolenko · Journal of Computational Biology · 2012
The lion's share of bacteria in various environments cannot be cloned in the laboratory and thus cannot be sequenced using existing technologies. A major goal of single-cell genomics is to complement gene-centric metagen...
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STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner
Artículo
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STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner
Alexander Dobin; Carrie Davis; Felix Schlesinger; Jörg Drenkow; Chris Zaleski; Sonali Jha; Philippe Batut; Mark Chaisson · Bioinformatics · 2012
MOTIVATION: Accurate alignment of high-throughput RNA-seq data is a challenging and yet unsolved problem because of the non-contiguous transcript structure, relatively short read lengths and constantly increasing through...
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