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BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs
Artículo
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BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs
Felipe A. Simão; Robert M. Waterhouse; Panagiotis Ioannidis; Evgenia V. Kriventseva; Evgeny M. Zdobnov · Bioinformatics · 2015
MOTIVATION: Genomics has revolutionized biological research, but quality assessment of the resulting assembled sequences is complicated and remains mostly limited to technical measures like N50. RESULTS: We propose a mea...
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limma powers differential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies
Artículo
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limma powers differential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies
Matthew E. Ritchie; Belinda Phipson; Di Wu; Yifang Hu; Charity W. Law; Wei Shi; Gordon K. Smyth · Nucleic Acids Research · 2015
limma is an R/Bioconductor software package that provides an integrated solution for analysing data from gene expression experiments. It contains rich features for handling complex experimental designs and for informatio...
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