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FieldTrip: Open Source Software for Advanced Analysis of MEG, EEG, and Invasive Electrophysiological Data
Artículo
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FieldTrip: Open Source Software for Advanced Analysis of MEG, EEG, and Invasive Electrophysiological Data
Robert Oostenveld; Pascal Fries; Eric Maris; Jan‐Mathijs Schoffelen · Computational Intelligence and Neuroscience · 2010
This paper describes FieldTrip, an open source software package that we developed for the analysis of MEG, EEG, and other electrophysiological data. The software is implemented as a MATLAB toolbox and includes a complete...
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<i>PHENIX</i>: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution
Artículo
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<i>PHENIX</i>: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution
Paul D. Adams; Pavel V. Afonine; G. Bunkóczi; Vincent B. Chen; Ian Davis; Nathaniel Echols; Jeffrey J. Headd; Li‐Wei Hung · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2010
Macromolecular X-ray crystallography is routinely applied to understand biological processes at a molecular level. However, significant time and effort are still required to solve and complete many of these structures be...
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BEDTools: a flexible suite of utilities for comparing genomic features
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BEDTools: a flexible suite of utilities for comparing genomic features
Aaron R. Quinlan; Ira M. Hall · Bioinformatics · 2010
MOTIVATION: Testing for correlations between different sets of genomic features is a fundamental task in genomics research. However, searching for overlaps between features with existing web-based methods is complicated ...
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Features and development of <i>Coot</i>
Artículo
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Features and development of <i>Coot</i>
Paul Emsley; Bernhard Lohkamp; W. G. Scott; Kevin Cowtan · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2010
Coot is a molecular-graphics application for model building and validation of biological macromolecules. The program displays electron-density maps and atomic models and allows model manipulations such as idealization, r...
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