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QUAST: quality assessment tool for genome assemblies
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QUAST: quality assessment tool for genome assemblies
Alexey Gurevich; Vladislav Saveliev; Nikolay Vyahhi; Glenn Tesler · Bioinformatics · 2013
SUMMARY: Limitations of genome sequencing techniques have led to dozens of assembly algorithms, none of which is perfect. A number of methods for comparing assemblers have been developed, but none is yet a recognized ben...
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phyloseq: An R Package for Reproducible Interactive Analysis and Graphics of Microbiome Census Data
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phyloseq: An R Package for Reproducible Interactive Analysis and Graphics of Microbiome Census Data
Paul J. McMurdie; Susan Holmes · PLoS ONE · 2013
BACKGROUND: the analysis of microbial communities through dna sequencing brings many challenges: the integration of different types of data with methods from ecology, genetics, phylogenetics, multivariate statistics, vis...
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