The Sequence Alignment/Map format and SAMtools

Heng Li; Bob Handsaker; Alec Wysoker; Tim Fennell; Jue Ruan; Nils Homer; Gábor Marth; Gonçalo R. Abecasis · Bioinformatics · 2009

Página del recurso

Lectura rápida. Revisá los datos básicos del recurso y luego accedé al contenido desde el botón principal. En esta ficha solo se muestra la información necesaria para identificar la obra, citarla y abrirla.

Autor / responsable

Heng Li; Bob Handsaker; Alec Wysoker; Tim Fennell; Jue Ruan; Nils Homer; Gábor Marth; Gonçalo R. Abecasis

Editorial

Bioinformatics

Año

2009

Idioma

en

Acceso al recurso

Entrá al contenido desde la opción principal o elegí otra fuente disponible.

Acceso principal

Página del recurso

Página de referencia del recurso. El texto completo no está confirmado automáticamente.

Abrir recurso

Resumen

Descripción general del contenido del recurso.

SUMMARY: The Sequence Alignment/Map (SAM) format is a generic alignment format for storing read alignments against reference sequences, supporting short and long reads (up to 128 Mbp) produced by different sequencing platforms. It is flexible in style, compact in size, efficient in random access and is the format in which alignments from the 1000 Genomes Project are released. SAMtools implements various utilities for post-processing alignments in the SAM format, such as indexing, variant caller and alignment viewer, and thus provides universal tools for processing read alignments. AVAILABILITY: http://samtools.sourceforge.net.

Cómo citar

Elegí el formato que necesitás y copiá la referencia al portapapeles.

APA 7

Li, H, Handsaker, B, Wysoker, A, Fennell, T, Ruan, J, Homer, N, Marth, G, & Abecasis, G. R. (2009). The Sequence Alignment/Map format and SAMtools. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp352

MLA

Li, Heng, et al. "The Sequence Alignment/Map format and SAMtools." 2009. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp352.

Chicago

Li, Heng, Bob Handsaker, Alec Wysoker, Tim Fennell, Jue Ruan, Nils Homer, Gábor Marth, and Gonçalo R. Abecasis. 2009. "The Sequence Alignment/Map format and SAMtools.". https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp352.

Harvard

Li, H. et al. 2009, The Sequence Alignment/Map format and SAMtools, Bioinformatics, available at: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp352 [Accessed 29 Jun. 2026].

Compartir e imprimir

Guardá la ficha, copiá su enlace permanente o imprimila como PDF.

Exportar referencia

Si usás un gestor bibliográfico, podés exportar el registro en los formatos más comunes.

RIS BibTeX

Detalles del recurso

Información bibliográfica útil para confirmar que se trata del material correcto.

Título: The Sequence Alignment/Map format and SAMtools

Autor / colaboradores: Heng Li; Bob Handsaker; Alec Wysoker; Tim Fennell; Jue Ruan; Nils Homer; Gábor Marth; Gonçalo R. Abecasis

Editorial: Bioinformatics

Año de publicación: 2009

Idioma: en

Materias

Explorá otros recursos relacionados a partir de estas materias.

Computer science; Search engine indexing; Sequence alignment; k-mer; Multiple sequence alignment; File format; Sanger sequencing; Sequence (biology); Alignment-free sequence analysis; Information retrieval; Computational biology; Genome