Análisis integral de la genómica y transcriptómica de Tritrichomonas foetus, revela la existencia de genes asociados con la adaptación al hospedador.

Tesis de Ingeniería Tritrichomonas foetus es un protozoo flagelado que reside como parásito o comensal en los tractos gastrointestinales y reproductivos de sus hospedadores. A pesar de ser un importante parásito patógeno venéreo que afecta al ganado bovino y agente causal de diarrea crónica en el gato doméstico, los mecanismos que definen la especificidad por el hospedador, hasta ahora son desconocidos. En este trabajo integramos la información genómica y transcriptómica disponibles de parásitos obtenidos de distintos hospedadores (bovino, felino, y porcino), para determinar los perfiles de expresión génica de T. foetus asociados a cada contexto. Demostramos la existencia de patrones de genes co-expresados específicos para cada aislamiento y relacionados con proteasas. Por otro lado, nuestro análisis diferencial reveló factores de transcripción conocidos (proteínas de unión a ADN del tipo Myb) y genes asociados al proceso de fosforilación de proteínas. En conclusión proponemos a los genes previamente mencionados, como determinantes en la adaptación de T. foetus a los distintos huéspedes. Con este enfoque integrado generamos un recurso útil para estudios futuros sobre la interacción hospedador-parásito y para la identificación de posibles nuevos blancos que permitan diseñar tanto nuevas estrategias diagnósticas como terapéuticas. Tritrichomonas foetus is a flagellated parasite able to infect cattle, cats, and pigs. Despite its prevalence, feline tritrichomonosis has received markedly less attention than venereal infection, and little information about the molecular mechanisms that participate in feline host infection is available. Through a bioinformatics approach, we integrated public transcriptomic data for three T. foetus isolates and explored the differences at transcript level with a focus on pathogenesis and adaptation processes, particularly for the feline isolate. Our analysis revealed higher abundance levels of predicted virulence factors, such as proteases and surface antigens. Additionally, by a comparative and expression analysis of T. foetus genes, we proposed putative virulence factors that could be involved in feline infection. Finally, we identified a great proportion of predicted transcription factors of the MYB protein family and, by a promoter analysis, we revealed that MYB-related proteins could participate in the regulation of gene transcription in T. foetus. In conclusion, this integrated approach is a valuable resource for future studies of host–pathogen interactions and identifying new gene targets for improved feline tritrichomonosis diagnosis and treatment.