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43 resultados encontrados.

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Graphical Models
Artículo
Material complementario disponible Artículo DOAJ
Elsevier; United States · ISSN 1524-0703
Materias / palabras clave: graphical models, animation, visualization; Science; Technology: Technology (General)
Idioma English
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Material complementario
<i>Coot</i>: model-building tools for molecular graphics
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Paul Emsley; Kevin Cowtan · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2004
CCP4mg is a project that aims to provide a general-purpose tool for structural biologists, providing tools for X-ray structure solution, structure comparison and analysis, and publication-quality graphics. The map-fittin...
Idioma en
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Material complementario
<i>EXPGUI</i>, a graphical user interface for<i>GSAS</i>
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Brian H. Toby · Journal of Applied Crystallography · 2001
A description and justification of the EXPGUI program is presented. This program implements a graphical user interface and shell for the GSAS single-crystal and Rietveld package. Use of the Tcl/Tk scripting language allo...
Idioma en
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Material complementario
<i>ORTEP</i>-3 for Windows - a version of<i>ORTEP</i>-III with a Graphical User Interface (GUI)
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Louis J. Farrugia · Journal of Applied Crystallography · 1997
Computer Program Abstracts The category Computer Program Abstracts provides a rapid means of communicating up-to-date information concerning both new programs or systems and significant updates to existing ones. Followin...
Idioma en
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Material complementario
CHARMM‐GUI: A web‐based graphical user interface for CHARMM
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Sunhwan Jo; Taehoon Kim; Vidyashankara Iyer; Wonpil Im · Journal of Computational Chemistry · 2008
CHARMM is an academic research program used widely for macromolecular mechanics and dynamics with versatile analysis and manipulation tools of atomic coordinates and dynamics trajectories. CHARMM-GUI, http://www.charmm-g...
Idioma en
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Material complementario
Matplotlib: A 2D Graphics Environment
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
John D. Hunter · Computing in Science & Engineering · 2007
Matplotlib is a 2D graphics package used for Python for application development, interactive scripting,and publication-quality image generation across user interfaces and operating systems
Idioma en
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Material complementario
phyloseq: An R Package for Reproducible Interactive Analysis and Graphics of Microbiome Census Data
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Paul J. McMurdie; Susan Holmes · PLoS ONE · 2013
BACKGROUND: the analysis of microbial communities through dna sequencing brings many challenges: the integration of different types of data with methods from ecology, genetics, phylogenetics, multivariate statistics, vis...
Idioma en
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Material complementario
Silhouettes: A graphical aid to the interpretation and validation of cluster analysis
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Peter J. Rousseeuw · Journal of Computational and Applied Mathematics · 1987
Materias / palabras clave: Silhouette; Cluster analysis; Mathematics; Cluster (spacecraft); Graphical display; Interpretation (philosophy); Artificial intelligence; Pattern recognition (psychology); Plot (graphics); Computer science; Statistics; C...
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Material complementario
ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Cedric E. Ginestet · Journal of the Royal Statistical Society Series A (Statistics in Society) · 2011
Materias / palabras clave: Graphics; Statistical analysis; Citation; Library science; Computer science; Psychology; Statistics; Mathematics; Computer graphics (images)
Idioma en
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Material complementario
International Journal of Graphic Design
Artículo
Material complementario disponible Artículo DOAJ
Universitas Sains dan Teknologi Komputer; Indonesia · ISSN 2988-0343
Materias / palabras clave: graphic design, visual communication, digital media, design theory and practice; Fine Arts: Drawing. Design. Illustration
Idioma English
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Material complementario
Journal of Graphic Engineering and Design
Artículo
Material complementario disponible Artículo DOAJ
University of Novi Sad; Serbia · ISSN 2217-379X
Materias / palabras clave: engineering graphics, computer graphics, graphic design, typography, engineering, printmaking; Technology: Technology (General): Mechanical drawing. Engineering graphics
Idioma English
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Material complementario
<i>PHENIX</i>: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Paul D. Adams; Pavel V. Afonine; G. Bunkóczi; Vincent B. Chen; Ian Davis; Nathaniel Echols; Jeffrey J. Headd; Li‐Wei Hung · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2010
Macromolecular X-ray crystallography is routinely applied to understand biological processes at a molecular level. However, significant time and effort are still required to solve and complete many of these structures be...
Idioma en
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Material complementario
Features and development of <i>Coot</i>
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Paul Emsley; Bernhard Lohkamp; W. G. Scott; Kevin Cowtan · Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2010
Coot is a molecular-graphics application for model building and validation of biological macromolecules. The program displays electron-density maps and atomic models and allows model manipulations such as idealization, r...
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Material complementario
From dissertation abstracts international
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
ACM SIGGRAPH Computer Graphics · 1974
In the following are the graphics related Ph.D. dissertation abstracts that appeared in the January 74 thru October 74 issues of Dissertation Abstracts International. The complete dissertations are available on microfilm...
Idioma en
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Material complementario
Marching cubes: A high resolution 3D surface construction algorithm
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
William E. Lorensen; H. E. Cline · ACM SIGGRAPH Computer Graphics · 1987
We present a new algorithm, called marching cubes , that creates triangle models of constant density surfaces from 3D medical data. Using a divide-and-conquer approach to generate inter-slice connectivity, we create a ca...
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Material complementario
VMD: Visual molecular dynamics
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
William Humphrey; Andrew Dalke; Klaus Schulten · Journal of Molecular Graphics · 1996
Materias / palabras clave: Computer science; Computer graphics (images); Scripting language; Visualization; Rendering (computer graphics); Molecular graphics; Programming language; Python (programming language); Graphics; Software; Computer graphi...
Idioma en
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<i>ATHENA</i>,<i>ARTEMIS</i>,<i>HEPHAESTUS</i>: data analysis for X-ray absorption spectroscopy using<i>IFEFFIT</i>
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Bruce Ravel; M. Newville · Journal of Synchrotron Radiation · 2005
A software package for the analysis of X-ray absorption spectroscopy (XAS) data is presented. This package is based on the IFEFFIT library of numerical and XAS algorithms and is written in the Perl programming language u...
Idioma he
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<i>OLEX2</i>: a complete structure solution, refinement and analysis program
Artículo
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Oleg V. Dolomanov; Luc J. Bourhis; Richard J. Gildea; Judith A. K. Howard; Horst Puschmann · Journal of Applied Crystallography · 2009
New software, OLEX2 , has been developed for the determination, visualization and analysis of molecular crystal structures. The software has a portable mouse-driven workflow-oriented and fully comprehensive graphical use...
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<i>SIR</i>97: a new tool for crystal structure determination and refinement
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Angela Altomare; M. C. Burla; Mercedes Camalli; G. Cascarano; Carmelo Giacovazzo; Antonietta Guagliardi; Anna Moliterni; G. Polidori · Journal of Applied Crystallography · 1999
SIR 97 is the integration of two programs, SIR 92 and CAOS , the first devoted to the solution of crystal structures by direct methods, the second to refinement via least-squares–Fourier procedures. Several new feature...
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Material complementario
<i>WinGX</i>and<i>ORTEP for Windows</i>: an update
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Louis J. Farrugia · Journal of Applied Crystallography · 2012
The WinGX suite provides a complete set of programs for the treatment of small-molecule single-crystal diffraction data, from data reduction and processing, structure solution, model refinement and visualization, and met...
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Material complementario
<scp>UCSF ChimeraX</scp>: Structure visualization for researchers, educators, and developers
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Eric F. Pettersen; Thomas D. Goddard; Conrad C. Huang; Elaine C. Meng; Gregory S. Couch; Tristan I. Croll; John H. Morris; Thomas E. Ferrin · Protein Science · 2020
UCSF ChimeraX is the next-generation interactive visualization program from the Resource for Biocomputing, Visualization, and Informatics (RBVI), following UCSF Chimera. ChimeraX brings (a) significant performance and gr...
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AutoDock4 and AutoDockTools4: Automated docking with selective receptor flexibility
Artículo
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Garrett M. Morris; Ruth Huey; William Lindstrom; Michel F. Sanner; Richard K. Belew; David S. Goodsell; Arthur J. Olson · Journal of Computational Chemistry · 2009
We describe the testing and release of AutoDock4 and the accompanying graphical user interface AutoDockTools. AutoDock4 incorporates limited flexibility in the receptor. Several tests are reported here, including a redoc...
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Material complementario
Avogadro: an advanced semantic chemical editor, visualization, and analysis platform
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Marcus D. Hanwell; Donald Curtis; David Lonie; Tim Vandermeersch; Eva Zurek; Geoffrey Hutchison · Journal of Cheminformatics · 2012
BACKGROUND: The Avogadro project has developed an advanced molecule editor and visualizer designed for cross-platform use in computational chemistry, molecular modeling, bioinformatics, materials science, and related are...
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Material complementario
ColabFold: making protein folding accessible to all
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Milot Mirdita; Konstantin Schütze; Yoshitaka Moriwaki; Lim Heo; Sergey Ovchinnikov; Martin Steinegger · Nature Methods · 2022
ColabFold offers accelerated prediction of protein structures and complexes by combining the fast homology search of MMseqs2 with AlphaFold2 or RoseTTAFold. ColabFold's 40-60-fold faster search and optimized model utiliz...
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