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Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research
Artículo
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Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research
Ana Conesa; Stefan Götz; Juan Miguel García-Gómez; Javier Terol; Manuel Talón; Montserrat Robles · Bioinformatics · 2005
SUMMARY: We present here Blast2GO (B2G), a research tool designed with the main purpose of enabling Gene Ontology (GO) based data mining on sequence data for which no GO annotation is yet available. B2G joints in one app...
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InterProScan 5: genome-scale protein function classification
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InterProScan 5: genome-scale protein function classification
Philip Jones; David Binns; Hsin-Yu Chang; Matthew Fraser; Weizhong Li; Craig McAnulla; Hamish McWilliam; John Maslen · Bioinformatics · 2014
Abstract Motivation: Robust large-scale sequence analysis is a major challenge in modern genomic science, where biologists are frequently trying to characterize many millions of sequences. Here, we describe a new Java-ba...
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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
Zuguang Gu; Roland Eils; Matthias Schlesner · Bioinformatics · 2016
UNLABELLED: Parallel heatmaps with carefully designed annotation graphics are powerful for efficient visualization of patterns and relationships among high dimensional genomic data. Here we present the ComplexHeatmap pac...
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