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The Sequence Alignment/Map format and SAMtools
Artículo
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The Sequence Alignment/Map format and SAMtools
Heng Li; Bob Handsaker; Alec Wysoker; Tim Fennell; Jue Ruan; Nils Homer; Gábor Marth; Gonçalo R. Abecasis · Bioinformatics · 2009
SUMMARY: The Sequence Alignment/Map (SAM) format is a generic alignment format for storing read alignments against reference sequences, supporting short and long reads (up to 128 Mbp) produced by different sequencing pla...
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Fast and accurate short read alignment with Burrows–Wheeler transform
Artículo
Material complementario disponible Artículo OpenAlex
Fast and accurate short read alignment with Burrows–Wheeler transform
Heng Li; Richard Durbin · Bioinformatics · 2009
MOTIVATION: The enormous amount of short reads generated by the new DNA sequencing technologies call for the development of fast and accurate read alignment programs. A first generation of hash table-based methods has be...
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