Análisis comparativo de pipelines de procesamiento y algoritmos de detección de ensambles neuronales para imágenes de calcio

"En los últimos años, las imágenes de calcio se han convertido en una valiosa herramienta para registrar actividad neuronal en diversas áreas del cerebro. La disponibilidad de microscopios de fluorescencia miniaturizados y de bajo costo permite un mayor acceso a investigaciones de neurociencias, entre las cuales se destaca el estudio de la formación y consolidación de memorias en el hipocampo. El gran caudal de células que pueden ser visualizadas con estas técnicas, y la posibilidad de realizar estudios con animales comportándose libremente permiten obtener información valiosa sobre diversas áreas de interés. Estos registros, sin embargo, deben ser acompañados por extensos procesos de corrección, procesamiento, y deconvolución de las señales para aportar información útil. En este proyecto se trabajó con registros de actividad en la región CA3 del hipocampo de un ratón (Mus musculus) sobre el cual se implementaron distintos pipelines de procesamiento de imágenes de calcio, los cuales fueron comparados según su robustez ante distintos niveles de ruido. También se evaluó la consistencia de algoritmos de detección de ensambles neuronales, conjuntos de neuronas que presentan coactivación y que se cree que forman la base del procesamiento neuronal de la información." Proyecto final Bioingeniería (grado) - Instituto Tecnológico de Buenos Aires, Buenos Aires, 2021